32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0013 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0013  integrase, catalytic region  100 
 
 		 554 aa  1147    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0608  putative integrase protein  94.48 
 
 		 344 aa  679    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.346201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0166  putative integrase protein  52.29 
 
 		 553 aa  595  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13890  putative integrase protein  68.53 
 
 		 336 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216731  normal  0.122609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0386  phage integrase family site specific recombinase  64.65 
 
 		 306 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6635  putative integrase protein  57.1 
 
 		 373 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000253479  hitchhiker  0.0000000190144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0607  putative integrase protein  95.24 
 
 		 106 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0606  hypothetical protein  87.1 
 
 		 81 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.171846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  24.3 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  24.3 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  24.3 
 
 		 417 aa  73.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3697  hypothetical protein  26.19 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  23.7 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  23.11 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  23.11 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  23.11 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  23.11 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2273  hypothetical protein  25.15 
 
 		 597 aa  52  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  23.36 
 
 		 341 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  24.34 
 
 		 489 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1894  Integrase catalytic region  23.78 
 
 		 666 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  24.81 
 
 		 495 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1396  hypothetical protein  21.54 
 
 		 585 aa  48.5  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  21.99 
 
 		 459 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  21.99 
 
 		 459 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  21.99 
 
 		 459 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  21.99 
 
 		 459 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  24.94 
 
 		 493 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  24.94 
 
 		 493 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  25.64 
 
 		 276 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  25.52 
 
 		 469 aa  44.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3239  integrase catalytic subunit  23.2 
 
 		 330 aa  43.5  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>