More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12826 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12826  transposase  100 
 
 
469 aa  946    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  62.08 
 
 
510 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2928  integrase catalytic subunit  61.47 
 
 
499 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171579  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0571  integrase catalytic subunit  61.47 
 
 
499 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  61.13 
 
 
522 aa  531  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2501  integrase catalytic subunit  61.47 
 
 
499 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1688  integrase catalytic subunit  61.47 
 
 
499 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  59.78 
 
 
489 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  59.08 
 
 
493 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  59.08 
 
 
493 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  58.7 
 
 
495 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  34.55 
 
 
426 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  33.25 
 
 
417 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  32.98 
 
 
417 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  32.98 
 
 
417 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  29.15 
 
 
441 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  29.15 
 
 
441 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  29.15 
 
 
441 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  29.15 
 
 
441 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  33.07 
 
 
416 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  31.96 
 
 
459 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  31.96 
 
 
459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  31.96 
 
 
459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  31.67 
 
 
459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  33.54 
 
 
341 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3239  integrase catalytic subunit  32.28 
 
 
330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  31.52 
 
 
497 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  31.52 
 
 
497 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  31.52 
 
 
497 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13804  transposase  90.48 
 
 
63 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105315  normal  0.474302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0552  putative transposase  60.44 
 
 
97 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6466  Integrase catalytic region  29.24 
 
 
478 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6582  Integrase catalytic region  29.24 
 
 
478 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0318996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0099  Integrase catalytic region  29.24 
 
 
478 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5181  Integrase catalytic region  29.24 
 
 
478 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0130  Integrase catalytic region  29.24 
 
 
478 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7260  Integrase catalytic region  29.24 
 
 
478 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  24.93 
 
 
481 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6374  transposase Tn6049  31.02 
 
 
479 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.038009  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6335  transposase Tn6049  31.02 
 
 
479 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000710666  hitchhiker  0.00105142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0321  integrase catalytic subunit  31.02 
 
 
479 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2000  integrase catalytic subunit  31.02 
 
 
479 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2008  integrase catalytic subunit  31.02 
 
 
479 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160475  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2405  integrase catalytic subunit  31.02 
 
 
479 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000242595  decreased coverage  0.0000044189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2552  integrase catalytic subunit  31.02 
 
 
479 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.338431  normal  0.288762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2837  integrase catalytic subunit  31.02 
 
 
479 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3142  integrase catalytic subunit  31.02 
 
 
479 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.943926  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3931  transposase Tn6049  31.02 
 
 
479 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0145396  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4424  transposase Tn6049  31.02 
 
 
479 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0079465  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5480  transposase Tn6049  31.02 
 
 
479 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41731  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1122  putative transposase protein  28.84 
 
 
478 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0710  putative integrase  28.84 
 
 
478 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112967 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  24.93 
 
 
481 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  29.41 
 
 
389 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  29.41 
 
 
389 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  29.41 
 
 
389 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  29.41 
 
 
389 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  29.3 
 
 
383 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
468 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  28.98 
 
 
383 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  29.3 
 
 
383 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2853  integrase catalytic subunit  34.68 
 
 
462 aa  96.7  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2273  integrase catalytic subunit  34.68 
 
 
484 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2125  integrase catalytic subunit  34.68 
 
 
484 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0458  integrase catalytic subunit  34.68 
 
 
484 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0942  integrase catalytic subunit  34.68 
 
 
484 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1322  integrase catalytic subunit  34.68 
 
 
484 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1330  integrase catalytic subunit  34.68 
 
 
484 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  31.63 
 
 
379 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  31.63 
 
 
379 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  31.63 
 
 
379 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  31.63 
 
 
379 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  31.63 
 
 
379 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  28.99 
 
 
391 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  28.99 
 
 
391 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  28.99 
 
 
391 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  30.08 
 
 
380 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  27.58 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  26.94 
 
 
480 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  26.94 
 
 
480 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  27.73 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  27.73 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  27.73 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  27.73 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  27.58 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4799  Integrase catalytic region  31.25 
 
 
385 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  27.19 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  27.19 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  27.19 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  27.19 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  27.19 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  27.19 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  27.19 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  27.19 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  27.19 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  29.61 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0336  Integrase catalytic region  30.86 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  28.52 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  25.26 
 
 
724 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  27.9 
 
 
338 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>