More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3338 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  100 
 
 		 380 aa  790    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  52.11 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  52.11 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  52.11 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  51.23 
 
 		 377 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  51.23 
 
 		 377 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  51.23 
 
 		 377 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  51.23 
 
 		 377 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  50.68 
 
 		 377 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  48.68 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  48.68 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  48.68 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  48.68 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  48.68 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  48.68 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  48.68 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  48.68 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  48.68 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  50.27 
 
 		 389 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  49.87 
 
 		 389 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  50.97 
 
 		 369 aa  355  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.87 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  50.97 
 
 		 369 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.87 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.87 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.87 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  49.87 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  49.61 
 
 		 389 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.87 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  49.61 
 
 		 389 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  49.87 
 
 		 381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  51.99 
 
 		 400 aa  346  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  48.41 
 
 		 383 aa  338  8e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  48.15 
 
 		 383 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  47.88 
 
 		 383 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  48.68 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  48.68 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  48.68 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  48.68 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  48.68 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4799  Integrase catalytic region  55.63 
 
 		 385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0336  Integrase catalytic region  55.28 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  46.69 
 
 		 276 aa  246  6e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2234  Integrase catalytic region  32.99 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715682  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2172  Integrase catalytic region  32.99 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.0206375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4351  Integrase catalytic region  32.99 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1246  Integrase catalytic region  33.25 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0188803  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0692  Integrase catalytic region  34.26 
 
 		 391 aa  192  9e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2320  integrase catalytic subunit  34.07 
 
 		 382 aa  185  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.801318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3288  integrase catalytic subunit  34.07 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.672557  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0837  integrase catalytic subunit  34.07 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.767179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2464  integrase catalytic subunit  34.07 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3160  integrase catalytic subunit  34.07 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1761  Integrase catalytic region  32.8 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0735  integrase catalytic subunit  32.04 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4098  Integrase catalytic region  32.7 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  30.29 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  30.29 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  30.29 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  30.29 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  30.29 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  30.03 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3520  integrase catalytic subunit  28.61 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.674245  normal  0.0855075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2426  integrase catalytic region  30.99 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3925  integrase catalytic region  30.99 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4290  integrase catalytic region  30.99 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.530909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4272  integrase catalytic region  30.99 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.489775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2414  integrase catalytic region  30.99 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1743  integrase catalytic region  30.99 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  32.99 
 
 		 597 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  30.93 
 
 		 607 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  30.92 
 
 		 324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  30.92 
 
 		 324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  30.92 
 
 		 324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  30.92 
 
 		 324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0795  Integrase catalytic region  28.27 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1710  integrase catalytic subunit  27.6 
 
 		 426 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0622  integrase catalytic subunit  27.6 
 
 		 426 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1731  integrase catalytic subunit  27.6 
 
 		 426 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.742948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0635  integrase catalytic subunit  27.6 
 
 		 426 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1778  integrase catalytic subunit  27.6 
 
 		 426 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.12662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2082  helix-turn-helix, Fis-type  29.55 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2099  helix-turn-helix, Fis-type  29.55 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0640  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0660  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0872  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1018  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1299  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1492  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.246201  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1932  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1945  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1964  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2047  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2135  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2329  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137968  normal  0.366873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2674  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2866  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3086  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3112  helix-turn-helix, Fis-type  29.21 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>