More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1778 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0795  Integrase catalytic region  74.41 
 
 		 425 aa  645    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1710  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 426 aa  870    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0622  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 426 aa  870    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1731  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 426 aa  870    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.742948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0635  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 426 aa  870    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1778  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 426 aa  870    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.12662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0615  integrase catalytic subunit  97.71 
 
 		 307 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28440  integrase family protein  58.06 
 
 		 434 aa  491  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04580  integrase family protein  57.83 
 
 		 434 aa  488  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1834  integrase catalytic subunit  57.11 
 
 		 387 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1842  integrase catalytic subunit  57.11 
 
 		 387 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  34.46 
 
 		 391 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  34.46 
 
 		 391 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  34.46 
 
 		 391 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4799  Integrase catalytic region  33.96 
 
 		 385 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0336  Integrase catalytic region  33.58 
 
 		 385 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  30.92 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  30.92 
 
 		 389 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  31.08 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  27.56 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  31.08 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  29.12 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  28.91 
 
 		 379 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  28.91 
 
 		 379 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  28.91 
 
 		 379 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  28.91 
 
 		 379 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  28.91 
 
 		 379 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  27.37 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  27.37 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  29.2 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  34.28 
 
 		 607 aa  113  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  27.89 
 
 		 380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  27.4 
 
 		 377 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  27.4 
 
 		 377 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  27.4 
 
 		 377 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  27.05 
 
 		 369 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  27.4 
 
 		 369 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  31.19 
 
 		 597 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  27.05 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  27.14 
 
 		 381 aa  106  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  27.14 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  27.14 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  27.14 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  27.14 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  27.14 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  27.14 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  27.05 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  27.51 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  28.62 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  28.62 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  28.62 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  28.62 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  28.62 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3520  integrase catalytic subunit  28.73 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.674245  normal  0.0855075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2234  Integrase catalytic region  28.2 
 
 		 402 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715682  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2172  Integrase catalytic region  28.2 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.0206375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4351  Integrase catalytic region  28.2 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1246  Integrase catalytic region  28.2 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0188803  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0692  Integrase catalytic region  28.08 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3160  integrase catalytic subunit  26.15 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3288  integrase catalytic subunit  26.15 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.672557  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2320  integrase catalytic subunit  26.15 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.801318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0837  integrase catalytic subunit  26.15 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.767179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2464  integrase catalytic subunit  26.15 
 
 		 382 aa  95.5  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1761  Integrase catalytic region  26.77 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4098  Integrase catalytic region  26.77 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0735  integrase catalytic subunit  26.26 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  28.17 
 
 		 276 aa  90.1  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6453  Integrase catalytic region  31.29 
 
 		 326 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2451  integrase catalytic subunit  27.65 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.908146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0870  helix-turn-helix, Fis-type  29.31 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1143  helix-turn-helix, Fis-type  29.31 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2407  helix-turn-helix, Fis-type  29.31 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49226  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2433  helix-turn-helix, Fis-type  29.31 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0656957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2865  helix-turn-helix, Fis-type  29.31 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2879  helix-turn-helix, Fis-type  29.31 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.676741  normal  0.87637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2941  helix-turn-helix, Fis-type  29.31 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3106  helix-turn-helix, Fis-type  29.31 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  28.48 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  28.48 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  29.31 
 
 		 495 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  29.31 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  28.48 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  28.48 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  28.48 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  28.48 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0640  helix-turn-helix, Fis-type  28.87 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1018  helix-turn-helix, Fis-type  28.87 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1299  helix-turn-helix, Fis-type  28.87 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2665  helix-turn-helix, Fis-type  28.87 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2819  helix-turn-helix, Fis-type  28.87 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>