More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2180 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  100 
 
 		 400 aa  811    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  62.68 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  62.97 
 
 		 377 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  62.97 
 
 		 377 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  62.97 
 
 		 377 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  62.1 
 
 		 377 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  64.39 
 
 		 389 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  64.39 
 
 		 389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  64.1 
 
 		 389 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  64.1 
 
 		 389 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  62.57 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  62.28 
 
 		 369 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  54.24 
 
 		 391 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  54.24 
 
 		 391 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  54.24 
 
 		 391 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  51.99 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  51.27 
 
 		 379 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  51.27 
 
 		 379 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  51.27 
 
 		 379 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  51.27 
 
 		 379 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  51.27 
 
 		 379 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  49.86 
 
 		 381 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.86 
 
 		 381 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.86 
 
 		 381 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.86 
 
 		 381 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  49.86 
 
 		 381 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.86 
 
 		 381 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  49.86 
 
 		 381 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  49.44 
 
 		 383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  49.44 
 
 		 383 aa  325  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  49.16 
 
 		 383 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  47.03 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  47.03 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  47.03 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  47.03 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  47.03 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  47.03 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  47.03 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  47.03 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  47.03 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4799  Integrase catalytic region  55.52 
 
 		 385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0336  Integrase catalytic region  55.16 
 
 		 385 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  42.97 
 
 		 276 aa  216  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2172  Integrase catalytic region  36.61 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.0206375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4351  Integrase catalytic region  36.61 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2234  Integrase catalytic region  36.61 
 
 		 402 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715682  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1246  Integrase catalytic region  36.61 
 
 		 402 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0188803  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1761  Integrase catalytic region  36.64 
 
 		 407 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4098  Integrase catalytic region  36.62 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0692  Integrase catalytic region  35.01 
 
 		 391 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0735  integrase catalytic subunit  33.42 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2464  integrase catalytic subunit  34.26 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3160  integrase catalytic subunit  34.26 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2320  integrase catalytic subunit  33.98 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.801318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  34.87 
 
 		 597 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3288  integrase catalytic subunit  33.98 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.672557  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0837  integrase catalytic subunit  33.98 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.767179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3520  integrase catalytic subunit  34.35 
 
 		 392 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.674245  normal  0.0855075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  33.64 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  33.64 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  33.64 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  33.64 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  33.64 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  33.64 
 
 		 395 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  33.78 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  35.49 
 
 		 607 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2414  integrase catalytic region  32.4 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1743  integrase catalytic region  32.4 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2426  integrase catalytic region  32.4 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4290  integrase catalytic region  32.4 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.530909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4272  integrase catalytic region  32.4 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.489775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3925  integrase catalytic region  32.4 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0795  Integrase catalytic region  30.15 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1710  integrase catalytic subunit  30.86 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1778  integrase catalytic subunit  30.86 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.12662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0622  integrase catalytic subunit  30.86 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1731  integrase catalytic subunit  30.86 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.742948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0635  integrase catalytic subunit  30.86 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1834  integrase catalytic subunit  29.31 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0615  integrase catalytic subunit  30.71 
 
 		 307 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1842  integrase catalytic subunit  29.31 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04580  integrase family protein  30.48 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28440  integrase family protein  30.48 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0640  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0660  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0872  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1018  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1299  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1492  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.246201  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1932  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1945  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1964  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2047  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2135  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2665  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2674  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2819  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2866  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3086  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3112  helix-turn-helix, Fis-type  29.22 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>