More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3168 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  100 
 
 		 395 aa  820    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  100 
 
 		 395 aa  820    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  100 
 
 		 395 aa  820    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  100 
 
 		 395 aa  820    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  99.75 
 
 		 395 aa  818    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  100 
 
 		 395 aa  820    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0735  integrase catalytic subunit  54.87 
 
 		 391 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1414  transposase  99.5 
 
 		 218 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3520  integrase catalytic subunit  54.22 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.674245  normal  0.0855075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1409  integrase, catalytic region  99.49 
 
 		 209 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2234  Integrase catalytic region  46.21 
 
 		 402 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715682  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2172  Integrase catalytic region  46.19 
 
 		 402 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.0206375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4351  Integrase catalytic region  46.19 
 
 		 402 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1246  Integrase catalytic region  45.69 
 
 		 402 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0188803  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0692  Integrase catalytic region  42.63 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2464  integrase catalytic subunit  36.95 
 
 		 382 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2320  integrase catalytic subunit  36.95 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.801318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3288  integrase catalytic subunit  36.95 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.672557  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3160  integrase catalytic subunit  36.95 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0837  integrase catalytic subunit  36.95 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.767179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1761  Integrase catalytic region  40.05 
 
 		 407 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4098  Integrase catalytic region  39.02 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  35.71 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  35.71 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  35.71 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  33.51 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  33.51 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  33.51 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  33.51 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  33.51 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  32.07 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  32.07 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  32.07 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  32.07 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  32.07 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  32.07 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  32.07 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  32.07 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  32.07 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  34.81 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4290  integrase catalytic region  34.57 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.530909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3925  integrase catalytic region  34.57 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2414  integrase catalytic region  34.57 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1743  integrase catalytic region  34.57 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4272  integrase catalytic region  34.57 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.489775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2426  integrase catalytic region  34.57 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  34.29 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  34.29 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  35.14 
 
 		 381 aa  180  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.86 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  34.86 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.86 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.86 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.86 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.86 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  30.24 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  33.44 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  32.96 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  32.96 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  33.64 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  35.02 
 
 		 377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  35.02 
 
 		 377 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  35.02 
 
 		 377 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  35.02 
 
 		 377 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  35.02 
 
 		 377 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  35.64 
 
 		 369 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  35.64 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4799  Integrase catalytic region  37.11 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  33.23 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0336  Integrase catalytic region  36.77 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  28.4 
 
 		 276 aa  130  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0795  Integrase catalytic region  30.5 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  30.17 
 
 		 338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  28.9 
 
 		 597 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2451  integrase catalytic subunit  30.84 
 
 		 326 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.908146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6453  Integrase catalytic region  29.61 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0622  integrase catalytic subunit  29.03 
 
 		 426 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1731  integrase catalytic subunit  29.03 
 
 		 426 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.742948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0635  integrase catalytic subunit  29.03 
 
 		 426 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1778  integrase catalytic subunit  29.03 
 
 		 426 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.12662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1710  integrase catalytic subunit  29.03 
 
 		 426 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0615  integrase catalytic subunit  28.88 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  28.52 
 
 		 324 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  28.52 
 
 		 324 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  28.52 
 
 		 324 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  28.52 
 
 		 324 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0640  helix-turn-helix, Fis-type  27.69 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0660  helix-turn-helix, Fis-type  27.69 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1018  helix-turn-helix, Fis-type  27.69 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1299  helix-turn-helix, Fis-type  27.69 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1492  helix-turn-helix, Fis-type  27.69 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.246201  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1932  helix-turn-helix, Fis-type  27.69 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1945  helix-turn-helix, Fis-type  27.69 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1964  helix-turn-helix, Fis-type  27.69 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2047  helix-turn-helix, Fis-type  27.69 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2135  helix-turn-helix, Fis-type  27.69 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2329  helix-turn-helix, Fis-type  27.69 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137968  normal  0.366873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2674  helix-turn-helix, Fis-type  27.69 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2866  helix-turn-helix, Fis-type  27.69 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3086  helix-turn-helix, Fis-type  27.69 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>