More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1834 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1834  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 387 aa  797    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1842  integrase catalytic subunit  99.74 
 
 		 387 aa  794    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0795  Integrase catalytic region  59.28 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1778  integrase catalytic subunit  56.12 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.12662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1710  integrase catalytic subunit  56.12 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0622  integrase catalytic subunit  56.12 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1731  integrase catalytic subunit  56.12 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.742948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0635  integrase catalytic subunit  56.12 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28440  integrase family protein  53.94 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04580  integrase family protein  53.69 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0615  integrase catalytic subunit  68.86 
 
 		 307 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  29.13 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  29.13 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  29.13 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  33.68 
 
 		 597 aa  116  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4799  Integrase catalytic region  29.92 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  28.83 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  26.77 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  27.69 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  31.29 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  31.29 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  31.29 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0336  Integrase catalytic region  29.55 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  31.29 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  29.31 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  33.92 
 
 		 607 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  28.36 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  28.36 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  28.36 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  28.36 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  28.36 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  28.36 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  25.99 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  25.99 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  25.99 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  25.99 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  25.99 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  27.99 
 
 		 369 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  33.09 
 
 		 338 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  27.34 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  27.34 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  27.34 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  27.34 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  27.34 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  27.34 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  27.34 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  27.34 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  27.34 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0692  Integrase catalytic region  27.99 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2234  Integrase catalytic region  30 
 
 		 402 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715682  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2172  Integrase catalytic region  30 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.0206375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4351  Integrase catalytic region  30 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1246  Integrase catalytic region  30 
 
 		 402 aa  92.8  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0188803  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  27.93 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  27.93 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0870  helix-turn-helix, Fis-type  29.97 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1143  helix-turn-helix, Fis-type  30.07 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2407  helix-turn-helix, Fis-type  30.07 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49226  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2433  helix-turn-helix, Fis-type  30.07 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0656957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2865  helix-turn-helix, Fis-type  30.07 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2879  helix-turn-helix, Fis-type  30.07 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.676741  normal  0.87637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2941  helix-turn-helix, Fis-type  30.07 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3106  helix-turn-helix, Fis-type  30.07 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  27.93 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  27.93 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  27.93 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  27.93 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  27.93 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  29.82 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  30.07 
 
 		 495 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  30.47 
 
 		 479 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  25.67 
 
 		 395 aa  89.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  25.67 
 
 		 395 aa  89.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  25.67 
 
 		 395 aa  89.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  25.67 
 
 		 395 aa  89.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  25.67 
 
 		 395 aa  89.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  30.38 
 
 		 785 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  25.67 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0735  integrase catalytic subunit  27.4 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3826  integrase catalytic subunit  29.43 
 
 		 326 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6453  Integrase catalytic region  31.1 
 
 		 326 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0640  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0660  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0872  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1018  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1299  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1492  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.246201  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1932  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1945  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1964  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2047  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2082  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2099  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2135  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2329  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137968  normal  0.366873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2674  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2819  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2866  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3086  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3112  helix-turn-helix, Fis-type  30.96 
 
 		 326 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>