More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0458 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  100 
 
 
338 aa  691    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  62.46 
 
 
597 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  54.52 
 
 
607 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  35.99 
 
 
379 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  35.99 
 
 
379 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  35.99 
 
 
379 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  35.99 
 
 
379 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  35.99 
 
 
379 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  34.68 
 
 
381 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.68 
 
 
381 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.68 
 
 
381 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.68 
 
 
381 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  34.68 
 
 
381 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.68 
 
 
381 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  34.68 
 
 
381 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  33.78 
 
 
400 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  34.66 
 
 
377 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  34.66 
 
 
377 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  34.66 
 
 
377 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  34.66 
 
 
369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  34.66 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  34.72 
 
 
377 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  34.3 
 
 
369 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  33.23 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  33.23 
 
 
383 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  33.23 
 
 
383 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  34.62 
 
 
391 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  34.62 
 
 
391 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  34.62 
 
 
391 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  31.83 
 
 
378 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  31.83 
 
 
378 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  31.83 
 
 
378 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  31.83 
 
 
378 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  31.83 
 
 
378 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  31.83 
 
 
378 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  31.83 
 
 
378 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  31.83 
 
 
378 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  31.83 
 
 
378 aa  146  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  32.77 
 
 
389 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  32.77 
 
 
389 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  32.77 
 
 
389 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  32.77 
 
 
389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4799  Integrase catalytic region  33.83 
 
 
385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04580  integrase family protein  34.01 
 
 
434 aa  126  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28440  integrase family protein  34.01 
 
 
434 aa  126  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0336  Integrase catalytic region  33.46 
 
 
385 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1761  Integrase catalytic region  32.04 
 
 
407 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4098  Integrase catalytic region  32.04 
 
 
399 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0795  Integrase catalytic region  33.56 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  31.19 
 
 
327 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  31.19 
 
 
327 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  33.64 
 
 
330 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  33.33 
 
 
330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  29.83 
 
 
395 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  29.83 
 
 
395 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  29.83 
 
 
395 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  30.14 
 
 
395 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  29.83 
 
 
395 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  29.83 
 
 
395 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3160  integrase catalytic subunit  28.81 
 
 
382 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40278  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2320  integrase catalytic subunit  28.81 
 
 
382 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.801318  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2464  integrase catalytic subunit  28.81 
 
 
382 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3288  integrase catalytic subunit  28.81 
 
 
382 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.672557  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0837  integrase catalytic subunit  28.81 
 
 
382 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.767179 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  32.38 
 
 
316 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  32.06 
 
 
316 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  32.06 
 
 
316 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  30.96 
 
 
417 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  30.96 
 
 
417 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  30.96 
 
 
417 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  32.59 
 
 
316 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1778  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
426 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.12662  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1710  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
426 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0622  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
426 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1731  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
426 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.742948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0635  integrase catalytic subunit  31.46 
 
 
426 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0615  integrase catalytic subunit  31.99 
 
 
307 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0692  Integrase catalytic region  28.86 
 
 
391 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  31.75 
 
 
316 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  31.75 
 
 
316 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1834  integrase catalytic subunit  33.09 
 
 
387 aa  99.4  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0735  integrase catalytic subunit  29.51 
 
 
391 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1842  integrase catalytic subunit  33.09 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 
441 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 
441 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 
441 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  27.05 
 
 
441 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  31.87 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  28.97 
 
 
316 aa  94  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5102  integrase catalytic subunit  32.65 
 
 
339 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  28.97 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  28.97 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  28.97 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  28.97 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  29.43 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  28.97 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>