More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2451 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2451  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 326 aa  679    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.908146 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5077  integrase catalytic subunit  90.19 
 
 		 266 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0640  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0660  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0865  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0872  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1018  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1299  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1492  helix-turn-helix, Fis-type  73.31 
 
 		 326 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.246201  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1932  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1945  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1964  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2047  helix-turn-helix, Fis-type  73.31 
 
 		 326 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2082  helix-turn-helix, Fis-type  73.31 
 
 		 326 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2099  helix-turn-helix, Fis-type  73.31 
 
 		 326 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2135  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2329  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137968  normal  0.366873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2358  helix-turn-helix, Fis-type  73.31 
 
 		 326 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0867438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2665  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2674  helix-turn-helix, Fis-type  73.31 
 
 		 326 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2819  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2866  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3086  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3112  helix-turn-helix, Fis-type  73.62 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6453  Integrase catalytic region  69.02 
 
 		 326 aa  484  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  71.47 
 
 		 785 aa  481  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1143  helix-turn-helix, Fis-type  71.47 
 
 		 326 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  71.47 
 
 		 495 aa  478  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2407  helix-turn-helix, Fis-type  71.47 
 
 		 326 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49226  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2433  helix-turn-helix, Fis-type  71.47 
 
 		 326 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0656957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2865  helix-turn-helix, Fis-type  71.47 
 
 		 326 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2879  helix-turn-helix, Fis-type  71.47 
 
 		 326 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.676741  normal  0.87637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2941  helix-turn-helix, Fis-type  71.47 
 
 		 326 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3106  helix-turn-helix, Fis-type  71.47 
 
 		 326 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3826  integrase catalytic subunit  71.17 
 
 		 326 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  71.47 
 
 		 479 aa  477  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4138  integrase catalytic subunit  70.55 
 
 		 326 aa  472  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5451  Integrase catalytic region  70.86 
 
 		 326 aa  471  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5505  Integrase catalytic region  70.86 
 
 		 326 aa  471  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0870  helix-turn-helix, Fis-type  72.64 
 
 		 353 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4906  integrase catalytic subunit  92.65 
 
 		 205 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.350856 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0782  integrase, catalytic region  73 
 
 		 237 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  52.53 
 
 		 324 aa  350  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  52.53 
 
 		 324 aa  350  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  52.53 
 
 		 324 aa  350  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  52.53 
 
 		 324 aa  350  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5096  hypothetical protein  90.38 
 
 		 156 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4624  helix-turn-helix, fis-type  73.97 
 
 		 156 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.318976  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4904  hypothetical protein  85.59 
 
 		 114 aa  195  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290887 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1264  putative transposase  71.43 
 
 		 138 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0536  putative transposase  30.55 
 
 		 336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1381  putative integrase  30.55 
 
 		 336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1841  integrase catalytic subunit  29.55 
 
 		 301 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1351  transposase and inactivated derivatives  30.23 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1645  integrase catalytic subunit  34.29 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  33.81 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  30.54 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  30.54 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  30.54 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  30.62 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  30.54 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  30.54 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  29.77 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  29.77 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  29.77 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  29.77 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  29.77 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  29.11 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  30.13 
 
 		 383 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  26.69 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  26.69 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  26.69 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  26.69 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  26.69 
 
 		 377 aa  99.8  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  29.8 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  27.08 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  29.47 
 
 		 383 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6150  hypothetical protein  70.77 
 
 		 82 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  27.08 
 
 		 369 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  28.76 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  28.76 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  28.76 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  28.62 
 
 		 378 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  28.62 
 
 		 378 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  28.62 
 
 		 378 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  28.62 
 
 		 378 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  28.62 
 
 		 378 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  28.62 
 
 		 378 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  28.62 
 
 		 378 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  28.62 
 
 		 378 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  28.62 
 
 		 378 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  26.89 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  26.89 
 
 		 389 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  26.89 
 
 		 389 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  26.89 
 
 		 389 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0963  transposase  31.52 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0993  transposase  31.52 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.078636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  27.8 
 
 		 381 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  27.8 
 
 		 381 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  27.8 
 
 		 381 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>