More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5451 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5505  Integrase catalytic region  100 
 
 
326 aa  665    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5451  Integrase catalytic region  100 
 
 
326 aa  665    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6453  Integrase catalytic region  91.1 
 
 
326 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0640  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337003  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0660  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0865  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0872  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1018  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1299  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1492  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.246201  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1932  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1945  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1964  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2047  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2135  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2329  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137968  normal  0.366873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2358  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0867438  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2665  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224592  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2674  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2819  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2866  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3086  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3112  helix-turn-helix, Fis-type  76.69 
 
 
326 aa  524  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2082  helix-turn-helix, Fis-type  76.38 
 
 
326 aa  523  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2099  helix-turn-helix, Fis-type  76.38 
 
 
326 aa  523  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4138  integrase catalytic subunit  75.46 
 
 
326 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3826  integrase catalytic subunit  76.38 
 
 
326 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  75.77 
 
 
785 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1143  helix-turn-helix, Fis-type  75.77 
 
 
326 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  75.77 
 
 
495 aa  511  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2407  helix-turn-helix, Fis-type  75.77 
 
 
326 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49226  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2433  helix-turn-helix, Fis-type  75.77 
 
 
326 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0656957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2865  helix-turn-helix, Fis-type  75.77 
 
 
326 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2879  helix-turn-helix, Fis-type  75.77 
 
 
326 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.676741  normal  0.87637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2941  helix-turn-helix, Fis-type  75.77 
 
 
326 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  75.77 
 
 
479 aa  511  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3106  helix-turn-helix, Fis-type  75.77 
 
 
326 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2451  integrase catalytic subunit  70.86 
 
 
326 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.908146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0870  helix-turn-helix, Fis-type  75.66 
 
 
353 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5077  integrase catalytic subunit  71.26 
 
 
266 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0782  integrase, catalytic region  76.37 
 
 
237 aa  394  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  56.07 
 
 
324 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  56.07 
 
 
324 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  56.07 
 
 
324 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  56.07 
 
 
324 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4906  integrase catalytic subunit  69 
 
 
205 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.350856 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5096  hypothetical protein  76.92 
 
 
156 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4624  helix-turn-helix, fis-type  68.49 
 
 
156 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.318976  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4904  hypothetical protein  78.38 
 
 
114 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.290887 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1264  putative transposase  73.21 
 
 
138 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0536  putative transposase  31.07 
 
 
336 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1381  putative integrase  31.07 
 
 
336 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1351  transposase and inactivated derivatives  30.71 
 
 
336 aa  132  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  34.03 
 
 
272 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1841  integrase catalytic subunit  29.18 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1645  integrase catalytic subunit  33.97 
 
 
259 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6150  hypothetical protein  88.06 
 
 
82 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25111  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  29.29 
 
 
377 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  29.29 
 
 
377 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  29.29 
 
 
377 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  29.29 
 
 
377 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  29.29 
 
 
377 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  30.42 
 
 
379 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  30.42 
 
 
379 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  30.42 
 
 
379 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  30.42 
 
 
379 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  30.42 
 
 
379 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  31.1 
 
 
391 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  31.1 
 
 
391 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  31.1 
 
 
391 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  29.66 
 
 
369 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  29.31 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.49 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.1 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.49 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  29.49 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.49 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.1 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  29.1 
 
 
381 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  28.52 
 
 
380 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  29.32 
 
 
383 aa  96.3  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  28.99 
 
 
383 aa  95.9  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3520  integrase catalytic subunit  28.93 
 
 
392 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.674245  normal  0.0855075 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  28.05 
 
 
395 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  28.05 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  28.05 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  28.05 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  28.05 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  28.05 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  27.69 
 
 
389 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  28.9 
 
 
400 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  28.66 
 
 
383 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  27.63 
 
 
389 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  27.69 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  27.69 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1855  putative transposase  27.62 
 
 
327 aa  89.7  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000952934  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4799  Integrase catalytic region  30.74 
 
 
385 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2306  integrase catalytic region  29.81 
 
 
362 aa  89.7  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2098  Integrase catalytic region  27.24 
 
 
327 aa  89.7  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3001  integrase catalytic region  29.81 
 
 
362 aa  89.7  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>