More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4906 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5077  integrase catalytic subunit  99.51 
 
 		 266 aa  431  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4906  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 205 aa  431  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.350856 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2451  integrase catalytic subunit  92.65 
 
 		 326 aa  400  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.908146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0782  integrase, catalytic region  73 
 
 		 237 aa  322  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2082  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  322  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2099  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  322  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0640  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0660  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0865  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0872  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1018  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1299  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1932  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1945  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1964  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2135  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2329  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137968  normal  0.366873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2665  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2819  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2866  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3086  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3112  helix-turn-helix, Fis-type  73 
 
 		 326 aa  321  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1492  helix-turn-helix, Fis-type  72.5 
 
 		 326 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.246201  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2047  helix-turn-helix, Fis-type  72.5 
 
 		 326 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2358  helix-turn-helix, Fis-type  72.5 
 
 		 326 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0867438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2674  helix-turn-helix, Fis-type  72.5 
 
 		 326 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3826  integrase catalytic subunit  68.66 
 
 		 326 aa  299  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  68.66 
 
 		 785 aa  298  3e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6453  Integrase catalytic region  66 
 
 		 326 aa  298  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1143  helix-turn-helix, Fis-type  68.66 
 
 		 326 aa  297  8e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2407  helix-turn-helix, Fis-type  68.66 
 
 		 326 aa  297  8e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49226  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2433  helix-turn-helix, Fis-type  68.66 
 
 		 326 aa  297  8e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0656957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2865  helix-turn-helix, Fis-type  68.66 
 
 		 326 aa  297  8e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2879  helix-turn-helix, Fis-type  68.66 
 
 		 326 aa  297  8e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.676741  normal  0.87637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2941  helix-turn-helix, Fis-type  68.66 
 
 		 326 aa  297  8e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3106  helix-turn-helix, Fis-type  68.66 
 
 		 326 aa  297  8e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  69 
 
 		 495 aa  296  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  69 
 
 		 479 aa  296  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4138  integrase catalytic subunit  68.16 
 
 		 326 aa  292  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5451  Integrase catalytic region  69 
 
 		 326 aa  288  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5505  Integrase catalytic region  69 
 
 		 326 aa  288  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0870  helix-turn-helix, Fis-type  67.39 
 
 		 353 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  54 
 
 		 324 aa  239  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  54 
 
 		 324 aa  239  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  54 
 
 		 324 aa  239  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  54 
 
 		 324 aa  239  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1841  integrase catalytic subunit  34.59 
 
 		 301 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1645  integrase catalytic subunit  33.67 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  36.21 
 
 		 272 aa  115  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0536  putative transposase  34.9 
 
 		 336 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1381  putative integrase  34.9 
 
 		 336 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1351  transposase and inactivated derivatives  34.38 
 
 		 336 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0963  transposase  33.9 
 
 		 279 aa  90.1  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0993  transposase  33.9 
 
 		 279 aa  90.1  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.078636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1871  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  88.6  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0349694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1214  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  88.2  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.933809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1797  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  87.8  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0038  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  88.2  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0597  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  87.8  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0681  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  87.8  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.606011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0684  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  87.8  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1167  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  87.8  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1993  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  87.8  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2330  transposase  34.91 
 
 		 251 aa  87.4  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1966  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  87.8  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1928  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  87.4  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.406161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0121  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  87.8  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0708  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  87.8  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.042465  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1292  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  87.8  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.572072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1357  transposase  33.9 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1365  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  87.8  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1493  transposase  33.9 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1504  transposase  33.9 
 
 		 284 aa  87.8  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0115  transposase  33.33 
 
 		 281 aa  86.7  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1591  transposase  33.33 
 
 		 284 aa  85.1  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.401924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1635  transposase  33.33 
 
 		 284 aa  85.1  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0795  Integrase catalytic region  32.94 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1677  transposase  34.94 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0906  transposase  33.33 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2299  transposase  34.32 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.224442  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  32.3 
 
 		 380 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5096  hypothetical protein  97.14 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  34.3 
 
 		 383 aa  82  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0639  IS5 family transposase orfB  31.14 
 
 		 273 aa  81.6  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1946  integrase catalytic region  32.54 
 
 		 298 aa  81.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.394231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  34.68 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  34.3 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4922  pyruvate, phosphate dikinase  58.67 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287654  normal  0.875905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5965  integrase catalytic subunit  29.02 
 
 		 440 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  32.35 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  32.35 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  32.35 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  32.35 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  32.35 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  32.35 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C59  transposase  33.33 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1778  integrase catalytic subunit  32.16 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.12662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0635  integrase catalytic subunit  32.16 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0622  integrase catalytic subunit  32.16 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1731  integrase catalytic subunit  32.16 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.742948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>