More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1797 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0597  transposase  100 
 
 
284 aa  589  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0684  transposase  99.65 
 
 
284 aa  588  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1167  transposase  100 
 
 
284 aa  589  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1214  transposase  99.65 
 
 
284 aa  587  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.933809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1797  transposase  100 
 
 
284 aa  589  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0121  transposase  99.65 
 
 
284 aa  587  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0708  transposase  99.3 
 
 
284 aa  585  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.042465  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0906  transposase  99.3 
 
 
284 aa  583  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1292  transposase  99.3 
 
 
284 aa  585  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.572072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1365  transposase  99.3 
 
 
284 aa  585  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1635  transposase  99.3 
 
 
284 aa  583  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1966  transposase  99.3 
 
 
284 aa  586  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1993  transposase  99.3 
 
 
284 aa  586  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0038  transposase  99.3 
 
 
284 aa  583  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1504  transposase  98.94 
 
 
284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1591  transposase  98.94 
 
 
284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.401924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1928  transposase  98.59 
 
 
284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.406161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1871  transposase  98.24 
 
 
284 aa  580  1e-164  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0349694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0681  transposase  98.24 
 
 
284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.606011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0115  transposase  97.86 
 
 
281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0963  transposase  98.57 
 
 
279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0993  transposase  98.57 
 
 
279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.078636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1677  transposase  90.85 
 
 
284 aa  541  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2330  transposase  88.38 
 
 
251 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2299  transposase  87.68 
 
 
251 aa  502  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.224442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1357  transposase  100 
 
 
240 aa  494  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C59  transposase  88.34 
 
 
234 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1493  transposase  100 
 
 
196 aa  410  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0353  transposase  100 
 
 
136 aa  287  1e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0103565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  45.11 
 
 
271 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  45.11 
 
 
271 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  45.11 
 
 
271 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  41.42 
 
 
277 aa  209  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  40.07 
 
 
270 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  40.07 
 
 
270 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  40.07 
 
 
270 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  40.07 
 
 
270 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  40.07 
 
 
270 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  39.85 
 
 
281 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  39.55 
 
 
291 aa  198  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  40.45 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  40.45 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  38.11 
 
 
272 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0663  transposase  37.78 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0850  transposase  37.78 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0854  transposase  37.78 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0884  transposase  37.78 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1036  transposase  37.78 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0036769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  37.78 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1671  transposase  37.78 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1413  transposase  37.78 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.143794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4217  Integrase catalytic region  37.08 
 
 
274 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0771  Integrase catalytic region  37.08 
 
 
274 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2546  Integrase catalytic region  36.7 
 
 
274 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  34.69 
 
 
286 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  34.69 
 
 
286 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  34.69 
 
 
286 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  34.69 
 
 
286 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  34.69 
 
 
286 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2557  Integrase catalytic region  35.32 
 
 
274 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  34.69 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  34.69 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  37.4 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  37.83 
 
 
279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2144  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  37.45 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  37.4 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  37.83 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  36.6 
 
 
379 aa  172  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  35.74 
 
 
295 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  35.74 
 
 
295 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  35.74 
 
 
295 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  35.74 
 
 
295 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  35.74 
 
 
295 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  36.6 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  36.84 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  36.6 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  36.6 
 
 
294 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  35.38 
 
 
295 aa  171  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  32.96 
 
 
286 aa  171  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>