More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1493 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0038  transposase  100 
 
 
284 aa  410  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0121  transposase  100 
 
 
284 aa  410  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0597  transposase  100 
 
 
284 aa  410  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0681  transposase  100 
 
 
284 aa  410  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.606011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0684  transposase  100 
 
 
284 aa  410  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0708  transposase  100 
 
 
284 aa  410  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.042465  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1167  transposase  100 
 
 
284 aa  410  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1292  transposase  100 
 
 
284 aa  410  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.572072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1365  transposase  100 
 
 
284 aa  410  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1504  transposase  100 
 
 
284 aa  410  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1797  transposase  100 
 
 
284 aa  410  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1214  transposase  99.49 
 
 
284 aa  408  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.933809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1357  transposase  100 
 
 
240 aa  407  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1493  transposase  100 
 
 
196 aa  407  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1591  transposase  99.49 
 
 
284 aa  407  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.401924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1635  transposase  99.49 
 
 
284 aa  407  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1871  transposase  98.98 
 
 
284 aa  407  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0349694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1928  transposase  99.49 
 
 
284 aa  409  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.406161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1966  transposase  98.98 
 
 
284 aa  407  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1993  transposase  98.98 
 
 
284 aa  407  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0906  transposase  98.98 
 
 
284 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0963  transposase  98.47 
 
 
279 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0993  transposase  98.47 
 
 
279 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.078636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0115  transposase  97.93 
 
 
281 aa  397  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1677  transposase  95.41 
 
 
284 aa  395  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2330  transposase  99.4 
 
 
251 aa  353  1e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2299  transposase  98.81 
 
 
251 aa  350  1e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.224442  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C59  transposase  89.62 
 
 
234 aa  345  2e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0353  transposase  100 
 
 
136 aa  285  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0103565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  45.45 
 
 
271 aa  177  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  45.45 
 
 
271 aa  176  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  45.45 
 
 
271 aa  176  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  42.71 
 
 
270 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  42.71 
 
 
270 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  42.71 
 
 
270 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  42.71 
 
 
270 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  42.71 
 
 
270 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  42.71 
 
 
270 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  42.71 
 
 
270 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  41.71 
 
 
281 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  41.62 
 
 
277 aa  152  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  42.27 
 
 
274 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  42.27 
 
 
286 aa  151  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  38.97 
 
 
272 aa  151  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  39.66 
 
 
293 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  39.66 
 
 
293 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2144  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  39.8 
 
 
379 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  40.23 
 
 
293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2112  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  40.23 
 
 
293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  40.1 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  40.23 
 
 
293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  39.8 
 
 
272 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.86 
 
 
286 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  39.8 
 
 
272 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.86 
 
 
286 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.86 
 
 
286 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36460  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.86 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  39.8 
 
 
272 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0663  transposase  41.99 
 
 
279 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0850  transposase  41.99 
 
 
279 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0854  transposase  41.99 
 
 
279 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0884  transposase  41.99 
 
 
279 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1036  transposase  41.99 
 
 
279 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0036769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  41.99 
 
 
279 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1671  transposase  41.99 
 
 
279 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  39.8 
 
 
294 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1413  transposase  41.99 
 
 
279 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.143794  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.86 
 
 
286 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.86 
 
 
286 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  39.8 
 
 
272 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  39.11 
 
 
295 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  39.11 
 
 
295 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  39.11 
 
 
295 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  39.11 
 
 
295 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  39.11 
 
 
295 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  39.8 
 
 
272 aa  145  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  39.11 
 
 
295 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  36.18 
 
 
286 aa  144  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>