More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0639 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0639  IS5 family transposase orfB  100 
 
 
273 aa  566  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C60  transposase  63.6 
 
 
357 aa  333  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C02  transposase  65.67 
 
 
234 aa  330  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  34.07 
 
 
279 aa  175  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5455  transposase catalytic site ISRme11  35.45 
 
 
283 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361338  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5497  transposase catalytic site ISRme11  35.45 
 
 
283 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  32.97 
 
 
279 aa  169  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  33.82 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  38.46 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  32.23 
 
 
290 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  34.36 
 
 
272 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  38.61 
 
 
291 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  31.39 
 
 
383 aa  159  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5425  integrase catalytic region  32.48 
 
 
277 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257494  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  32.48 
 
 
293 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  32.48 
 
 
293 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  32.48 
 
 
293 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  33.58 
 
 
283 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  30.71 
 
 
280 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  31.23 
 
 
270 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  31.23 
 
 
270 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  31.23 
 
 
270 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  31.23 
 
 
270 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  31.23 
 
 
270 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  31.23 
 
 
270 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  31.23 
 
 
270 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  31.23 
 
 
270 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  31.23 
 
 
270 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  31.23 
 
 
270 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  31.23 
 
 
270 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  31.23 
 
 
270 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  30.29 
 
 
274 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  30.71 
 
 
280 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  32.1 
 
 
279 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  32.1 
 
 
301 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  31.87 
 
 
288 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  32.71 
 
 
286 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  30.71 
 
 
286 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  30.71 
 
 
286 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  30.71 
 
 
286 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  30.71 
 
 
286 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  30.71 
 
 
286 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  30.71 
 
 
286 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  30.71 
 
 
286 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  30.71 
 
 
286 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  30.71 
 
 
286 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  30.71 
 
 
286 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  30.71 
 
 
286 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  32.71 
 
 
293 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  30.71 
 
 
286 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  30.71 
 
 
286 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  32.71 
 
 
293 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  31.73 
 
 
279 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  32.71 
 
 
293 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2557  Integrase catalytic region  32.96 
 
 
274 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  30.34 
 
 
286 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  32.71 
 
 
293 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  32.71 
 
 
293 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  30 
 
 
270 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  32.34 
 
 
289 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  31.23 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  31.23 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  31.23 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  31.23 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  31.23 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  31.7 
 
 
269 aa  152  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  31.7 
 
 
269 aa  152  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  31.7 
 
 
269 aa  152  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  33.58 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1288  integrase catalytic subunit  31.73 
 
 
271 aa  151  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01028  putative transposase for IS3  31.75 
 
 
271 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01360  IS3 element protein InsF  31.75 
 
 
288 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01525  putative transposase for IS3  31.75 
 
 
288 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1569  Integrase catalytic region  31.75 
 
 
288 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0876401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2506  Integrase catalytic region  31.75 
 
 
288 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.239261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2616  Integrase catalytic region  31.75 
 
 
288 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3237  Integrase catalytic region  31.75 
 
 
288 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3304  Integrase catalytic region  31.75 
 
 
288 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408812  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4704  ISEc16, orfB  31.75 
 
 
288 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01035  hypothetical protein  31.75 
 
 
288 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2570  integrase catalytic region  31.75 
 
 
288 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0458433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3716  integrase catalytic region  31.75 
 
 
288 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  32.32 
 
 
281 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  32.7 
 
 
390 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  32.7 
 
 
393 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1146  IS3, transposase orfB  31.75 
 
 
288 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3025  IS3, transposase orfB  32.46 
 
 
288 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0729  integrase catalytic region  31.75 
 
 
288 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3746  integrase catalytic region  31.75 
 
 
288 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.05522  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01520  hypothetical protein  31.75 
 
 
298 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  32.7 
 
 
390 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  32.7 
 
 
390 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  32.72 
 
 
278 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0683  integrase catalytic region  30.91 
 
 
291 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0398429  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0564  integrase catalytic region  30.91 
 
 
291 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.011287  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2665  integrase catalytic region  30.91 
 
 
291 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  30.82 
 
 
294 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3406  integrase catalytic region  30.45 
 
 
269 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4847  IS3, transposase orfB  31.39 
 
 
288 aa  149  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>