240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4922 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4922  pyruvate, phosphate dikinase  100 
 
 		 238 aa  498  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287654  normal  0.875905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2110  pyruvate phosphate dikinase  70.73 
 
 		 887 aa  301  5.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.865175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4859  pyruvate phosphate dikinase  67.63 
 
 		 889 aa  275  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1610  pyruvate phosphate dikinase  60.52 
 
 		 885 aa  270  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.617051  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_004310  BR0500  pyruvate phosphate dikinase  59.41 
 
 		 887 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2184  pyruvate phosphate dikinase  59.02 
 
 		 888 aa  245  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2808  pyruvate phosphate dikinase  58.05 
 
 		 896 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.307488 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0503  pyruvate phosphate dikinase  58.91 
 
 		 887 aa  244  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0686  pyruvate phosphate dikinase  57.92 
 
 		 887 aa  241  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463227  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1809  pyruvate phosphate dikinase  57.92 
 
 		 892 aa  241  9e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475254  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2026  pyruvate phosphate dikinase  59.51 
 
 		 896 aa  240  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2177  pyruvate phosphate dikinase  59.11 
 
 		 890 aa  239  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.799744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0717  pyruvate phosphate dikinase  57.14 
 
 		 901 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.681359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0729  pyruvate phosphate dikinase  58.42 
 
 		 922 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.378148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1102  pyruvate phosphate dikinase  61.67 
 
 		 894 aa  238  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883185  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2179  pyruvate phosphate dikinase  61.41 
 
 		 895 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.514386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3117  pyruvate phosphate dikinase  57.84 
 
 		 888 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38254  normal  0.157801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2891  pyruvate phosphate dikinase  57.84 
 
 		 888 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.929717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0494  pyruvate phosphate dikinase  57.07 
 
 		 886 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0662  pyruvate phosphate dikinase  56.16 
 
 		 894 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3014  pyruvate phosphate dikinase  58.21 
 
 		 888 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0716  pyruvate phosphate dikinase  56.1 
 
 		 899 aa  229  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3898  pyruvate phosphate dikinase  56.93 
 
 		 888 aa  229  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0548  pyruvate phosphate dikinase  54.23 
 
 		 898 aa  228  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462539  normal  0.844122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0580  pyruvate phosphate dikinase  54.63 
 
 		 888 aa  227  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2956  pyruvate phosphate dikinase  56.16 
 
 		 894 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2849  pyruvate phosphate dikinase  56.44 
 
 		 891 aa  225  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.543081  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0317  pyruvate phosphate dikinase  58.06 
 
 		 886 aa  224  7e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.45614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0644  pyruvate phosphate dikinase  56.1 
 
 		 914 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00825191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0772  pyruvate phosphate dikinase  55.12 
 
 		 887 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.134645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2710  pyruvate phosphate dikinase  55.45 
 
 		 891 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.772549  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0418  pyruvate phosphate dikinase  52.71 
 
 		 895 aa  223  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1211  pyruvate phosphate dikinase  51.98 
 
 		 882 aa  223  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.48137  normal  0.179954 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1409  pyruvate phosphate dikinase  55.74 
 
 		 883 aa  222  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000166258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3511  pyruvate phosphate dikinase  55.12 
 
 		 885 aa  222  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00038474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3566  pyruvate phosphate dikinase  53.66 
 
 		 892 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1224  pyruvate phosphate dikinase  55.45 
 
 		 1027 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0657  pyruvate phosphate dikinase  55.12 
 
 		 914 aa  221  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13952e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3671  pyruvate phosphate dikinase  54.15 
 
 		 886 aa  221  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000280199  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0158  pyruvate phosphate dikinase  53.62 
 
 		 881 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.103685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1099  pyruvate phosphate dikinase  57.84 
 
 		 1004 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.895703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2194  pyruvate phosphate dikinase  53.92 
 
 		 886 aa  219  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.193321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2360  pyruvate phosphate dikinase  54.63 
 
 		 987 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.797311  normal  0.119271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2940  pyruvate phosphate dikinase  52.68 
 
 		 888 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.915512  hitchhiker  0.000023243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4251  pyruvate phosphate dikinase  53.17 
 
 		 882 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0942  pyruvate, phosphate dikinase  51.96 
 
 		 893 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214985  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2709  pyruvate phosphate dikinase  53.66 
 
 		 1028 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3505  pyruvate phosphate dikinase  53.92 
 
 		 937 aa  217  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0745  pyruvate, phosphate dikinase  56.83 
 
 		 898 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1243  pyruvate phosphate dikinase  55.88 
 
 		 1008 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.147506  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1661  pyruvate phosphate dikinase  50.42 
 
 		 916 aa  216  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1351  pyruvate phosphate dikinase  45.8 
 
 		 877 aa  214  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154627  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0652  pyruvate phosphate dikinase  50.72 
 
 		 881 aa  214  8e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0676  pyruvate phosphate dikinase  50.72 
 
 		 881 aa  214  8e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2469  pyruvate phosphate dikinase  51.96 
 
 		 885 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2420  pyruvate, phosphate dikinase  53.55 
 
 		 907 aa  212  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.396323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0600  pyruvate phosphate dikinase  53.17 
 
 		 888 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000436246  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0155  pyruvate phosphate dikinase  54.55 
 
 		 916 aa  211  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1926  pyruvate phosphate dikinase  50.73 
 
 		 890 aa  210  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1512  pyruvate phosphate dikinase  51.46 
 
 		 880 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0629  pyruvate phosphate dikinase  47.93 
 
 		 916 aa  210  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0801  pyruvate phosphate dikinase  54.46 
 
 		 896 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0607  pyruvate phosphate dikinase  49.76 
 
 		 881 aa  209  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0607197  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4343  pyruvate phosphate dikinase  55.61 
 
 		 991 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.19603 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1318  pyruvate phosphate dikinase  46.25 
 
 		 889 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1308  pyruvate phosphate dikinase  47.22 
 
 		 883 aa  208  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2268  pyruvate phosphate dikinase  46.3 
 
 		 876 aa  208  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1983  pyruvate phosphate dikinase  46.3 
 
 		 876 aa  208  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2347  pyruvate phosphate dikinase  56.45 
 
 		 880 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0385  pyruvate phosphate dikinase  51.64 
 
 		 984 aa  207  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12273  hitchhiker  0.000630712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4089  pyruvate phosphate dikinase  50.67 
 
 		 932 aa  207  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1184  pyruvate, phosphate dikinase  55.19 
 
 		 878 aa  206  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1196  pyruvate phosphate dikinase  51.22 
 
 		 912 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1608  pyruvate phosphate dikinase  48.09 
 
 		 892 aa  204  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.470093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3044  pyruvate phosphate dikinase  51.71 
 
 		 887 aa  204  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.157532  normal  0.220677 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4187  pyruvate phosphate dikinase  50.23 
 
 		 961 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0757879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4160  pyruvate phosphate dikinase  50.23 
 
 		 961 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1059  pyruvate, phosphate dikinase  55.56 
 
 		 882 aa  202  3e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0518  pyruvate phosphate dikinase  46.69 
 
 		 940 aa  202  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1796  pyruvate, phosphate dikinase  54.1 
 
 		 881 aa  202  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0651  pyruvate phosphate dikinase  46.3 
 
 		 873 aa  202  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000914255  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1670  pyruvate phosphate dikinase  49.27 
 
 		 881 aa  202  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.4931  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0696  pyruvate phosphate dikinase  48.46 
 
 		 920 aa  201  6e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000314869  hitchhiker  0.0000641811 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0479  pyruvate phosphate dikinase  52.76 
 
 		 915 aa  202  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7028  pyruvate phosphate dikinase  54.74 
 
 		 905 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224146 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1387  pyruvate phosphate dikinase  50 
 
 		 912 aa  201  7e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.173139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2562  pyruvate phosphate dikinase  49.33 
 
 		 939 aa  201  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0607  pyruvate phosphate dikinase  53.16 
 
 		 884 aa  201  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1974  pyruvate phosphate dikinase  51.42 
 
 		 914 aa  201  8e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.188797  hitchhiker  0.000108707 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00390  pyruvate phosphate dikinase  48.83 
 
 		 903 aa  200  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149609  hitchhiker  0.0000341949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4044  pyruvate phosphate dikinase  50.24 
 
 		 962 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1276  pyruvate phosphate dikinase  54.1 
 
 		 897 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.214047 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0966  pyruvate phosphate dikinase  47.55 
 
 		 884 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.384178  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1243  pyruvate phosphate dikinase  46.22 
 
 		 876 aa  199  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0457  pyruvate phosphate dikinase  49.28 
 
 		 916 aa  198  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2762  pyruvate phosphate dikinase  50.99 
 
 		 886 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0523  pyruvate phosphate dikinase  50.24 
 
 		 916 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4080  pyruvate phosphate dikinase  50.25 
 
 		 908 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0311033  decreased coverage  0.000127188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1396  pyruvate phosphate dikinase  49.75 
 
 		 882 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1672  pyruvate, phosphate dikinase  54.64 
 
 		 903 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>