More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2299 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2299  transposase  100 
 
 		 251 aa  525  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.224442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2330  transposase  99.2 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0684  transposase  88.03 
 
 		 284 aa  503  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0906  transposase  87.68 
 
 		 284 aa  505  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0597  transposase  87.68 
 
 		 284 aa  502  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0708  transposase  87.68 
 
 		 284 aa  501  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.042465  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1167  transposase  87.68 
 
 		 284 aa  502  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1214  transposase  87.32 
 
 		 284 aa  500  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.933809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1292  transposase  87.68 
 
 		 284 aa  501  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.572072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1365  transposase  87.68 
 
 		 284 aa  501  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1797  transposase  87.68 
 
 		 284 aa  502  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0121  transposase  87.32 
 
 		 284 aa  499  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1504  transposase  87.32 
 
 		 284 aa  498  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1591  transposase  87.32 
 
 		 284 aa  498  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.401924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1635  transposase  86.97 
 
 		 284 aa  497  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1928  transposase  87.32 
 
 		 284 aa  498  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.406161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1966  transposase  87.32 
 
 		 284 aa  500  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1993  transposase  87.32 
 
 		 284 aa  500  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0038  transposase  86.97 
 
 		 284 aa  496  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1871  transposase  86.97 
 
 		 284 aa  496  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0349694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0681  transposase  86.62 
 
 		 284 aa  492  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.606011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0115  transposase  86.12 
 
 		 281 aa  488  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0963  transposase  86.02 
 
 		 279 aa  484  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0993  transposase  86.02 
 
 		 279 aa  484  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.078636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1677  transposase  81.34 
 
 		 284 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1357  transposase  85.77 
 
 		 240 aa  410  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1493  transposase  98.81 
 
 		 196 aa  350  2e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C59  transposase  74.89 
 
 		 234 aa  338  5e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0353  transposase  99.26 
 
 		 136 aa  283  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0103565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  39.85 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  39.85 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  39.85 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  38.26 
 
 		 277 aa  181  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  36.74 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1289  ISCps2, transposase orfB  34.72 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  36.74 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  36.74 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  36.74 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  36.74 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  36.74 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  34.44 
 
 		 281 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  37.88 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  37.88 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0663  transposase  34.07 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0850  transposase  34.07 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138656  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0854  transposase  34.07 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0884  transposase  34.07 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1036  transposase  34.07 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0036769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1087  transposase  34.07 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1671  transposase  34.07 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1413  transposase  34.07 
 
 		 279 aa  162  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.143794  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0645  IS30 family transposase  34.8 
 
 		 300 aa  150  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.358598  normal  0.401127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  33.72 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  32.09 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  33.72 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  32.09 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0894  ISCps3, transposase orfB  31.43 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274817  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0129  IS3 family transposase  34.83 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.384021  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1495  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.988108  normal  0.543791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1165  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1230  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460444 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  33.71 
 
 		 379 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1878  IS3 family transposase  34.83 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00866146  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  33.71 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  33.71 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  33.71 
 
 		 294 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3204  integrase catalytic subunit  34.83 
 
 		 279 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000772302  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1846  putative transposase  32.72 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796912  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2087  putative IS3 family transposase orfB  32.72 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2544  IS3 family transposase orfB  32.72 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2735  putative IS3 transposase integrase  32.72 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0386866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3565  putative transposase  32.72 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0131  putative transposase  32.72 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0634  putative transposase  32.72 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214662  normal  0.0414488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2144  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  34.85 
 
 		 289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  33.71 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  33.71 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>