More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5077 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5077  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 266 aa  555  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2451  integrase catalytic subunit  90.19 
 
 		 326 aa  502  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.908146 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4906  integrase catalytic subunit  99.51 
 
 		 205 aa  431  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.350856 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0640  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0660  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0865  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0872  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1018  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1299  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1932  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1945  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1964  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2135  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2329  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137968  normal  0.366873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2665  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2819  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2866  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3086  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3112  helix-turn-helix, Fis-type  75.48 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1492  helix-turn-helix, Fis-type  75.1 
 
 		 326 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.246201  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2047  helix-turn-helix, Fis-type  75.1 
 
 		 326 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2082  helix-turn-helix, Fis-type  75.1 
 
 		 326 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2099  helix-turn-helix, Fis-type  75.1 
 
 		 326 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2358  helix-turn-helix, Fis-type  75.1 
 
 		 326 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0867438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2674  helix-turn-helix, Fis-type  75.1 
 
 		 326 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  70.99 
 
 		 785 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3826  integrase catalytic subunit  70.99 
 
 		 326 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1143  helix-turn-helix, Fis-type  70.99 
 
 		 326 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  71.26 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2407  helix-turn-helix, Fis-type  70.99 
 
 		 326 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49226  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2433  helix-turn-helix, Fis-type  70.99 
 
 		 326 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0656957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2865  helix-turn-helix, Fis-type  70.99 
 
 		 326 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2879  helix-turn-helix, Fis-type  70.99 
 
 		 326 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.676741  normal  0.87637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2941  helix-turn-helix, Fis-type  70.99 
 
 		 326 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  71.26 
 
 		 479 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3106  helix-turn-helix, Fis-type  70.99 
 
 		 326 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6453  Integrase catalytic region  67.82 
 
 		 326 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4138  integrase catalytic subunit  70.23 
 
 		 326 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5505  Integrase catalytic region  71.26 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5451  Integrase catalytic region  71.26 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0782  integrase, catalytic region  75.43 
 
 		 237 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0870  helix-turn-helix, Fis-type  70.2 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  54.02 
 
 		 324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  54.02 
 
 		 324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  54.02 
 
 		 324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  54.02 
 
 		 324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5096  hypothetical protein  98.96 
 
 		 156 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.495591 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4624  helix-turn-helix, fis-type  73.26 
 
 		 156 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.318976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1841  integrase catalytic subunit  30.74 
 
 		 301 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1645  integrase catalytic subunit  32.9 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0536  putative transposase  32.28 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1381  putative integrase  32.28 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1351  transposase and inactivated derivatives  31.89 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  32.08 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4904  hypothetical protein  96.08 
 
 		 114 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  32.08 
 
 		 383 aa  95.5  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  32.08 
 
 		 383 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  31.67 
 
 		 383 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  29.49 
 
 		 380 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0963  transposase  33.51 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0993  transposase  33.51 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.078636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1871  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  89.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0349694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0681  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  88.6  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.606011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1214  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  88.6  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.933809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1928  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.406161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1797  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1993  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1966  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0038  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0121  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0597  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0684  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0708  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.042465  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1167  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1292  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.572072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1357  transposase  33.51 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1365  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1493  transposase  33.51 
 
 		 196 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1504  transposase  33.51 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0105855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2330  transposase  32.34 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0115  transposase  32.97 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00142442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1591  transposase  32.97 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.401924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1635  transposase  32.97 
 
 		 284 aa  85.9  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  31.53 
 
 		 395 aa  85.5  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  31.53 
 
 		 395 aa  85.5  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  31.53 
 
 		 395 aa  85.5  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  31.53 
 
 		 395 aa  85.5  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  31.53 
 
 		 395 aa  85.5  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  31.53 
 
 		 395 aa  85.5  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0795  Integrase catalytic region  32.94 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1677  transposase  34.94 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0906  transposase  32.97 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2299  transposase  31.84 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.224442  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.38 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.38 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  30.33 
 
 		 391 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  30.33 
 
 		 391 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.38 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.38 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  30.33 
 
 		 391 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>