More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2414 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4272  integrase catalytic region  100 
 
 		 387 aa  776    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.489775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4290  integrase catalytic region  100 
 
 		 387 aa  776    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.530909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3925  integrase catalytic region  100 
 
 		 387 aa  776    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1743  integrase catalytic region  100 
 
 		 387 aa  776    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2426  integrase catalytic region  100 
 
 		 387 aa  776    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2414  integrase catalytic region  100 
 
 		 387 aa  776    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.308967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0692  Integrase catalytic region  37.53 
 
 		 391 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2172  Integrase catalytic region  36.03 
 
 		 402 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.0206375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4351  Integrase catalytic region  36.03 
 
 		 402 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366675 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0735  integrase catalytic subunit  33.68 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2234  Integrase catalytic region  36.03 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715682  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1246  Integrase catalytic region  36.03 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0188803  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3520  integrase catalytic subunit  32.22 
 
 		 392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.674245  normal  0.0855075 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1761  Integrase catalytic region  36.87 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0886  integrase catalytic region  34.86 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4098  Integrase catalytic region  37.96 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2452  integrase catalytic region  34.57 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2308  integrase catalytic region  34.57 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3168  integrase catalytic region  34.57 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0686485  hitchhiker  0.0000277573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0954  integrase catalytic region  34.57 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1567  integrase catalytic region  34.57 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210525  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 389 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 389 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 389 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  33.86 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  30.99 
 
 		 380 aa  146  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2464  integrase catalytic subunit  30.34 
 
 		 382 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0837  integrase catalytic subunit  30.53 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.767179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2320  integrase catalytic subunit  30.53 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.801318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3160  integrase catalytic subunit  30.34 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3288  integrase catalytic subunit  30.53 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.672557  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  32.45 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  32.45 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  32.45 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  31.47 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  31.47 
 
 		 377 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  31.47 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  31.47 
 
 		 377 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  33.25 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  32.3 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  31.2 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  32.3 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  32.4 
 
 		 400 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  33.08 
 
 		 381 aa  136  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  33.08 
 
 		 381 aa  136  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  33.08 
 
 		 381 aa  136  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  33.08 
 
 		 381 aa  136  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  33.08 
 
 		 381 aa  136  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  33.08 
 
 		 381 aa  136  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  29.02 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  29.02 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  29.02 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  29.02 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  29.02 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  29.66 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  29.66 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  29.66 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  29.66 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  29.66 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  29.66 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  29.66 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  29.66 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  29.66 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  31.68 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  31.68 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  31.68 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4799  Integrase catalytic region  32.82 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0336  Integrase catalytic region  32.82 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1409  integrase, catalytic region  34.34 
 
 		 209 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1414  transposase  35.26 
 
 		 218 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  29.04 
 
 		 338 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  25.38 
 
 		 276 aa  87.8  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  28.86 
 
 		 597 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  28.35 
 
 		 607 aa  82.8  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  29.82 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  29.82 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  29.82 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  29.82 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  29.82 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  26.3 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  26.3 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  28.8 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  28.8 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  28.8 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  28.8 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  28.8 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  28.8 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  28.8 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  32.2 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  32.2 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  32.2 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  32.2 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  32.2 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7504  IS3 family transposase  29.9 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  26.09 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  26.09 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5023  integrase catalytic region  29.11 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  26.09 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  26.09 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  26.09 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>