18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0552 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0552  putative transposase  100 
 
 
97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0571  integrase catalytic subunit  100 
 
 
499 aa  191  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1688  integrase catalytic subunit  100 
 
 
499 aa  191  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2501  integrase catalytic subunit  100 
 
 
499 aa  191  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2928  integrase catalytic subunit  100 
 
 
499 aa  191  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171579  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  92.55 
 
 
510 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  88.3 
 
 
522 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  65.96 
 
 
489 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  64.89 
 
 
493 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  64.89 
 
 
495 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  64.89 
 
 
493 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  60.44 
 
 
469 aa  111  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13804  transposase  62.3 
 
 
63 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105315  normal  0.474302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1565  hypothetical protein  34.21 
 
 
669 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191847 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  31.87 
 
 
417 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  31.87 
 
 
417 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  31.87 
 
 
417 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  34.78 
 
 
416 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>