More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5572 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  67.58 
 
 		 489 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  66.95 
 
 		 493 aa  638    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  66.95 
 
 		 493 aa  638    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  66.95 
 
 		 495 aa  636    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 510 aa  1030    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2501  integrase catalytic subunit  88.18 
 
 		 499 aa  855    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2928  integrase catalytic subunit  88.18 
 
 		 499 aa  855    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171579  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0571  integrase catalytic subunit  88.18 
 
 		 499 aa  855    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1688  integrase catalytic subunit  88.18 
 
 		 499 aa  855    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  84.58 
 
 		 522 aa  835    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  62.08 
 
 		 469 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  34.17 
 
 		 426 aa  209  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0552  putative transposase  92.55 
 
 		 97 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  31.82 
 
 		 417 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  31.82 
 
 		 417 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  29.67 
 
 		 441 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  31.82 
 
 		 417 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  29.67 
 
 		 441 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  29.67 
 
 		 441 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  29.67 
 
 		 441 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  31.76 
 
 		 416 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  31.78 
 
 		 459 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  31.78 
 
 		 459 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  31.78 
 
 		 459 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  31.52 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  37.5 
 
 		 341 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3239  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  24.5 
 
 		 481 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  24.57 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  28.61 
 
 		 497 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  28.61 
 
 		 497 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  28.61 
 
 		 497 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  28.84 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  28.3 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  30.42 
 
 		 389 aa  93.6  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  30.42 
 
 		 389 aa  93.6  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  28.3 
 
 		 383 aa  93.2  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  30.42 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  30.42 
 
 		 389 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  23.02 
 
 		 480 aa  90.9  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  23.02 
 
 		 480 aa  90.9  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  29.57 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  29.57 
 
 		 377 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1122  putative transposase protein  26.83 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0710  putative integrase  26.83 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  29.57 
 
 		 377 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  29.57 
 
 		 377 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  28.84 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  28.84 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  28.84 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  28.84 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  29.18 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5181  Integrase catalytic region  26.72 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  29.18 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6582  Integrase catalytic region  26.72 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0318996 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7260  Integrase catalytic region  26.72 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0099  Integrase catalytic region  26.72 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6466  Integrase catalytic region  26.72 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  29.18 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0130  Integrase catalytic region  26.72 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3826  integrase catalytic subunit  29.63 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  26.9 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2273  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 		 484 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2125  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 		 484 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1330  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 		 484 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1322  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 		 484 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0942  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 		 484 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0458  integrase catalytic subunit  27.23 
 
 		 484 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  30.84 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1143  helix-turn-helix, Fis-type  29.11 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  30.84 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  30.84 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  30.84 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  30.84 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  30.84 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2407  helix-turn-helix, Fis-type  29.11 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49226  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2433  helix-turn-helix, Fis-type  29.11 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0656957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6453  Integrase catalytic region  28.77 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2865  helix-turn-helix, Fis-type  29.11 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2879  helix-turn-helix, Fis-type  29.11 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.676741  normal  0.87637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2941  helix-turn-helix, Fis-type  29.11 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  29.41 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  30.84 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3106  helix-turn-helix, Fis-type  29.11 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  30.84 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  29.14 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  29.14 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  29.14 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6374  transposase Tn6049  24.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.038009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6335  transposase Tn6049  24.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000710666  hitchhiker  0.00105142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0321  integrase catalytic subunit  24.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2000  integrase catalytic subunit  24.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2008  integrase catalytic subunit  24.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160475  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2405  integrase catalytic subunit  24.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000242595  decreased coverage  0.0000044189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2552  integrase catalytic subunit  24.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.338431  normal  0.288762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2837  integrase catalytic subunit  24.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3142  integrase catalytic subunit  24.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.943926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3931  transposase Tn6049  24.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0145396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4424  transposase Tn6049  24.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0079465  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5480  transposase Tn6049  24.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>