More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5446 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  84.58 
 
 		 510 aa  834    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  68.72 
 
 		 495 aa  659    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  68.72 
 
 		 493 aa  661    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  68.64 
 
 		 489 aa  661    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  68.72 
 
 		 493 aa  661    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0571  integrase catalytic subunit  86.63 
 
 		 499 aa  836    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2501  integrase catalytic subunit  86.63 
 
 		 499 aa  836    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1688  integrase catalytic subunit  86.63 
 
 		 499 aa  836    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 522 aa  1059    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2928  integrase catalytic subunit  86.63 
 
 		 499 aa  836    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171579  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  61.13 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  35.87 
 
 		 426 aa  206  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  31.2 
 
 		 441 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  31.2 
 
 		 441 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  31.2 
 
 		 441 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  31.2 
 
 		 441 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0552  putative transposase  88.3 
 
 		 97 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  32.82 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 417 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  32.56 
 
 		 459 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  32 
 
 		 416 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  39.26 
 
 		 341 aa  154  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3239  integrase catalytic subunit  33.85 
 
 		 330 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  28.5 
 
 		 497 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  28.5 
 
 		 497 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  28.5 
 
 		 497 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  24.41 
 
 		 481 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  24.41 
 
 		 481 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  22.86 
 
 		 480 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  22.86 
 
 		 480 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  27.79 
 
 		 468 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  29.62 
 
 		 389 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  29.62 
 
 		 389 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  29.62 
 
 		 389 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  29.62 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1322  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 484 aa  90.5  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1330  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 484 aa  90.5  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0942  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 484 aa  90.5  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0458  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 484 aa  90.5  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2273  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 484 aa  90.5  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2125  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 484 aa  90.5  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  28.62 
 
 		 383 aa  90.5  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  28.94 
 
 		 383 aa  90.1  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  29.96 
 
 		 377 aa  90.1  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  29.96 
 
 		 377 aa  90.1  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  29.96 
 
 		 377 aa  90.1  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  29.96 
 
 		 377 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  29.57 
 
 		 369 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  28.16 
 
 		 383 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  29.57 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7219  transposase  29.57 
 
 		 369 aa  88.6  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7260  Integrase catalytic region  27.59 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0099  Integrase catalytic region  27.59 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0130  Integrase catalytic region  27.59 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6582  Integrase catalytic region  27.59 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0318996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6466  Integrase catalytic region  27.59 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5181  Integrase catalytic region  27.59 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1122  putative transposase protein  27.59 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0710  putative integrase  27.59 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3826  integrase catalytic subunit  30.42 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2853  integrase catalytic subunit  31.71 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13804  transposase  63.93 
 
 		 63 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105315  normal  0.474302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  31.23 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  31.23 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  31.23 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  31.23 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  31.23 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6453  Integrase catalytic region  29.46 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  26.56 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6374  transposase Tn6049  25.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.038009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6335  transposase Tn6049  25.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000710666  hitchhiker  0.00105142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0321  integrase catalytic subunit  25.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2000  integrase catalytic subunit  25.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2008  integrase catalytic subunit  25.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160475  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2405  integrase catalytic subunit  25.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000242595  decreased coverage  0.0000044189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2552  integrase catalytic subunit  25.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.338431  normal  0.288762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2837  integrase catalytic subunit  25.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3142  integrase catalytic subunit  25.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.943926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3931  transposase Tn6049  25.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0145396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4424  transposase Tn6049  25.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0079465  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5480  transposase Tn6049  25.94 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  29.41 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.41 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.41 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.41 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.41 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  29.41 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  29.41 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0870  helix-turn-helix, Fis-type  29.58 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1143  helix-turn-helix, Fis-type  29.58 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2407  helix-turn-helix, Fis-type  29.58 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49226  normal  0.362833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2433  helix-turn-helix, Fis-type  29.58 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0656957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2865  helix-turn-helix, Fis-type  29.58 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2879  helix-turn-helix, Fis-type  29.58 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.676741  normal  0.87637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2941  helix-turn-helix, Fis-type  29.58 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3106  helix-turn-helix, Fis-type  29.58 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>