19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1565 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1565  hypothetical protein  100 
 
 		 669 aa  1359    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191847 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1613  hypothetical protein  41.8 
 
 		 667 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.564191  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  24.48 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3035  transposase protein  24.64 
 
 		 690 aa  57.4  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277466  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  24.49 
 
 		 497 aa  53.5  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  24.49 
 
 		 497 aa  53.5  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  24.49 
 
 		 497 aa  53.5  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 510 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4525  Mu DNA binding I gamma subdomain  22.63 
 
 		 656 aa  51.6  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  23.55 
 
 		 708 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0552  putative transposase  34.21 
 
 		 97 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0571  integrase catalytic subunit  34.21 
 
 		 499 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1688  integrase catalytic subunit  34.21 
 
 		 499 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2501  integrase catalytic subunit  34.21 
 
 		 499 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2928  integrase catalytic subunit  34.21 
 
 		 499 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171579  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 522 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  20.23 
 
 		 480 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  20.23 
 
 		 480 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  19.75 
 
 		 665 aa  44.3  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>