37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3068 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  100 
 
 		 688 aa  1425    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3035  transposase protein  82.17 
 
 		 690 aa  1172    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4525  Mu DNA binding I gamma subdomain  40.61 
 
 		 656 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  37.2 
 
 		 671 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2121  integrase catalytic subunit  37.27 
 
 		 705 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1279  integrase catalytic subunit  37.27 
 
 		 705 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2654  transposase, putative  37.44 
 
 		 669 aa  330  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  33.09 
 
 		 662 aa  326  7e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0650  transposase  36.25 
 
 		 667 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0686157  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0787  transposase  36.25 
 
 		 667 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000128606  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0100  putative transposase  30.37 
 
 		 627 aa  148  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.733769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  28.12 
 
 		 665 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  25.59 
 
 		 708 aa  88.6  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1264  Transposase-like Mu  26.91 
 
 		 728 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000119608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0713  Transposase-like Mu  23.55 
 
 		 732 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4119  integrase catalytic subunit  24.18 
 
 		 736 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000332444 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2907  integrase catalytic subunit  24.56 
 
 		 736 aa  62.4  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341428  normal  0.384956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1565  hypothetical protein  24.48 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191847 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  24.42 
 
 		 663 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0411  Integrase catalytic region  26.26 
 
 		 551 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00539616  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  23.53 
 
 		 497 aa  55.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  23.53 
 
 		 497 aa  55.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  23.53 
 
 		 497 aa  55.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  22.58 
 
 		 468 aa  55.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  23.85 
 
 		 772 aa  50.8  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  29.15 
 
 		 902 aa  50.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  21.78 
 
 		 810 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0270  bacteriophage DNA transposition protein A, putative  22.86 
 
 		 690 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.513793  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0216  transposase  28.36 
 
 		 684 aa  47.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  21.61 
 
 		 618 aa  47.8  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3389  integrase catalytic subunit  21.43 
 
 		 689 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  23.18 
 
 		 640 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  25.46 
 
 		 555 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  32.05 
 
 		 481 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  23.77 
 
 		 567 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  26.27 
 
 		 548 aa  43.9  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  43.75 
 
 		 481 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>