33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1049 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  100 
 
 		 662 aa  1375    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2654  transposase, putative  47.31 
 
 		 669 aa  618  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0650  transposase  47.5 
 
 		 667 aa  600  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0686157  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0787  transposase  47.5 
 
 		 667 aa  600  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000128606  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  37.1 
 
 		 671 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4525  Mu DNA binding I gamma subdomain  35.94 
 
 		 656 aa  323  6e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  32.79 
 
 		 688 aa  320  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3035  transposase protein  32.59 
 
 		 690 aa  309  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277466  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1279  integrase catalytic subunit  31.19 
 
 		 705 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2121  integrase catalytic subunit  31.19 
 
 		 705 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0100  putative transposase  27.69 
 
 		 627 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.733769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  25.33 
 
 		 665 aa  91.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  24.62 
 
 		 708 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4367  hypothetical protein  53.85 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  0.0748532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1050  putative repressor protein  55 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.678331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0713  Transposase-like Mu  23.67 
 
 		 732 aa  62.4  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3546  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  41.94 
 
 		 116 aa  60.1  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3483  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  36.23 
 
 		 128 aa  59.3  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000503276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0791  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  36.51 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000168449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0556  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  36.51 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000035991  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  42.37 
 
 		 772 aa  58.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3363  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  36.23 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000382153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0790  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  39.34 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000163331  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3759  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  42.86 
 
 		 115 aa  57.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00050742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3972  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  57.8  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000267115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3614  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  57.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219883  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1264  Transposase-like Mu  24.96 
 
 		 728 aa  57  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000119608 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0555  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  37.1 
 
 		 128 aa  57  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  29.11 
 
 		 715 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3482  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  40 
 
 		 136 aa  54.3  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000591006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3362  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  39.29 
 
 		 120 aa  51.6  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000035442  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4119  integrase catalytic subunit  22.03 
 
 		 736 aa  48.9  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000332444 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2907  integrase catalytic subunit  22.68 
 
 		 736 aa  47.8  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341428  normal  0.384956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>