38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1665 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  100 
 
 		 671 aa  1378    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1279  integrase catalytic subunit  42.32 
 
 		 705 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2121  integrase catalytic subunit  42.32 
 
 		 705 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3035  transposase protein  38.93 
 
 		 690 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4525  Mu DNA binding I gamma subdomain  42.56 
 
 		 656 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  41.49 
 
 		 688 aa  379  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  37.1 
 
 		 662 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2654  transposase, putative  34.99 
 
 		 669 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0787  transposase  36.19 
 
 		 667 aa  353  5.9999999999999994e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000128606  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0650  transposase  36.19 
 
 		 667 aa  353  5.9999999999999994e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0686157  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0100  putative transposase  29.85 
 
 		 627 aa  127  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.733769 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  25.52 
 
 		 708 aa  102  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1264  Transposase-like Mu  25.26 
 
 		 728 aa  97.8  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000119608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  24.82 
 
 		 665 aa  73.9  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0713  Transposase-like Mu  25.34 
 
 		 732 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0790  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  38.89 
 
 		 128 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000163331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3614  hypothetical protein  43.66 
 
 		 115 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219883  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0555  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  37.5 
 
 		 128 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3759  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  43.66 
 
 		 115 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00050742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3972  hypothetical protein  43.66 
 
 		 115 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000267115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4119  integrase catalytic subunit  25.24 
 
 		 736 aa  58.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000332444 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3546  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  38.46 
 
 		 116 aa  58.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2907  integrase catalytic subunit  24.76 
 
 		 736 aa  56.6  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341428  normal  0.384956 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1050  putative repressor protein  43.75 
 
 		 174 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.678331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  42.22 
 
 		 718 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  46.88 
 
 		 772 aa  55.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3482  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  39.39 
 
 		 136 aa  55.1  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000591006  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3483  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  33.78 
 
 		 128 aa  54.3  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000503276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  48.33 
 
 		 715 aa  54.3  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3363  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  39.34 
 
 		 128 aa  54.3  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000382153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0791  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  34.72 
 
 		 124 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000168449  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4367  hypothetical protein  49.15 
 
 		 216 aa  53.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  0.0748532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0556  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  34.72 
 
 		 124 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000035991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0216  transposase  23.56 
 
 		 684 aa  52.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  25.31 
 
 		 548 aa  51.6  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3362  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  45.28 
 
 		 120 aa  49.7  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000035442  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1613  hypothetical protein  29.05 
 
 		 667 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.564191  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  23.64 
 
 		 551 aa  44.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>