More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0411 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0411  Integrase catalytic region  100 
 
 		 551 aa  1145    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00539616  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0216  transposase  27.62 
 
 		 684 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0713  Transposase-like Mu  23.31 
 
 		 732 aa  88.2  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2907  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 736 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341428  normal  0.384956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4119  integrase catalytic subunit  23.48 
 
 		 736 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000332444 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  22.4 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  22.84 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2380  hypothetical protein  24.58 
 
 		 833 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  25.9 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  25.9 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  25.9 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  25.18 
 
 		 708 aa  73.6  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  22.56 
 
 		 480 aa  73.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  22.56 
 
 		 480 aa  73.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1264  Transposase-like Mu  23.49 
 
 		 728 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000119608 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  24.76 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2329  integrase catalytic subunit  33.78 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558623 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1946  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.394231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3414  Integrase catalytic region  31.29 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0270  bacteriophage DNA transposition protein A, putative  24.15 
 
 		 690 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.513793  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1439  ISRSO12-transposase ORFB protein  28.67 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2706  ISRSO12-transposase ORFB protein  28.67 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.147887 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  28.67 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0504  ISRSO12-transposase ORFB protein  28.67 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  28.67 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2337  integrase catalytic subunit  33.11 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3392  Integrase catalytic region  31.29 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  23.18 
 
 		 626 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  25.52 
 
 		 618 aa  59.7  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  22.9 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  22.9 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  22.9 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  23.71 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  23.71 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  23.71 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  24.35 
 
 		 721 aa  58.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  23.71 
 
 		 677 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3389  integrase catalytic subunit  24.93 
 
 		 689 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2069  integrase catalytic region  28.39 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  27.35 
 
 		 209 aa  56.6  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  27.35 
 
 		 209 aa  56.6  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2063  transposase  30.61 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000046959  decreased coverage  0.0000244555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2586  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3545  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4318  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2334  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4311  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3683  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  26.26 
 
 		 688 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2624  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2091  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3063  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1932  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3568  Integrase catalytic region  26.49 
 
 		 794 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  23.31 
 
 		 617 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4443  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472308  normal  0.634079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0252  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0455  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1097  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1143  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0742479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1259  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1263  integrase catalytic subunit  27.54 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  21.17 
 
 		 724 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  28.21 
 
 		 231 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0067  integrase catalytic region  27.4 
 
 		 251 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  28.21 
 
 		 231 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  22.17 
 
 		 541 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  22.17 
 
 		 541 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  22.17 
 
 		 541 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  22.17 
 
 		 541 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  28.21 
 
 		 231 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  28.21 
 
 		 231 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1475  integrase catalytic subunit  29.05 
 
 		 342 aa  54.7  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2168  integrase catalytic subunit  29.05 
 
 		 342 aa  54.7  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  25 
 
 		 644 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  24.43 
 
 		 284 aa  54.7  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2564  Integrase catalytic region  30.61 
 
 		 294 aa  54.3  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0069  integrase core subunit  27.78 
 
 		 178 aa  54.3  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.8827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  29.41 
 
 		 278 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  24.55 
 
 		 489 aa  53.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  24.26 
 
 		 174 aa  53.9  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  24.26 
 
 		 174 aa  53.9  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  23.7 
 
 		 240 aa  53.9  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  23.7 
 
 		 240 aa  53.9  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  23.7 
 
 		 240 aa  53.9  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 273 aa  53.5  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 273 aa  53.5  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  27.27 
 
 		 273 aa  53.5  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  29.73 
 
 		 715 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  29.73 
 
 		 715 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02043  hypothetical protein  28.38 
 
 		 336 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  28.43 
 
 		 278 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  32.71 
 
 		 260 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01718  hypothetical protein  28.38 
 
 		 336 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05755  hypothetical protein  28.38 
 
 		 336 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1901  integrase catalytic region  32.71 
 
 		 157 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  28.43 
 
 		 278 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05296  hypothetical protein  28.38 
 
 		 336 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06978  hypothetical protein  28.38 
 
 		 336 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05476  hypothetical protein  28.38 
 
 		 336 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>