30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1279 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2121  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 705 aa  1428    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1279  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 705 aa  1428    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4525  Mu DNA binding I gamma subdomain  44.48 
 
 		 656 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  42.03 
 
 		 671 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3035  transposase protein  38.85 
 
 		 690 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277466  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  37.14 
 
 		 688 aa  379  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2654  transposase, putative  32.56 
 
 		 669 aa  312  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0650  transposase  34.42 
 
 		 667 aa  301  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0686157  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0787  transposase  34.42 
 
 		 667 aa  301  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000128606  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  31.93 
 
 		 662 aa  277  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0100  putative transposase  30.72 
 
 		 627 aa  120  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.733769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  28.37 
 
 		 665 aa  107  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  24.65 
 
 		 724 aa  95.1  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  24.89 
 
 		 708 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0713  Transposase-like Mu  23.78 
 
 		 732 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1264  Transposase-like Mu  23.88 
 
 		 728 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000119608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  25.28 
 
 		 718 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2907  integrase catalytic subunit  26.14 
 
 		 736 aa  57  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341428  normal  0.384956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4119  integrase catalytic subunit  27.34 
 
 		 736 aa  54.3  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000332444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  24.9 
 
 		 555 aa  54.3  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  29.26 
 
 		 284 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  21.92 
 
 		 663 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0216  transposase  23.82 
 
 		 684 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  22.82 
 
 		 738 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  25 
 
 		 626 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  24.24 
 
 		 567 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  23.35 
 
 		 900 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  23.35 
 
 		 900 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  22.44 
 
 		 738 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1565  hypothetical protein  23.88 
 
 		 669 aa  43.9  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>