100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2907 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2907  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 736 aa  1489    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341428  normal  0.384956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4119  integrase catalytic subunit  93.48 
 
 		 736 aa  1271    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000332444 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0216  transposase  35.08 
 
 		 684 aa  297  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0713  Transposase-like Mu  31.81 
 
 		 732 aa  266  8e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2380  hypothetical protein  33.87 
 
 		 833 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  26.57 
 
 		 708 aa  102  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0411  Integrase catalytic region  24.26 
 
 		 551 aa  90.1  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00539616  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1264  Transposase-like Mu  23.75 
 
 		 728 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000119608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  27.02 
 
 		 772 aa  76.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  26.54 
 
 		 548 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  23.54 
 
 		 555 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  24.56 
 
 		 688 aa  62.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0100  putative transposase  27.66 
 
 		 627 aa  61.6  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.733769 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  25.66 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  25.66 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  25.77 
 
 		 665 aa  60.8  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  25.66 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3035  transposase protein  24.16 
 
 		 690 aa  58.9  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277466  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  23.5 
 
 		 567 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2654  transposase, putative  21.65 
 
 		 669 aa  57  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  24.76 
 
 		 671 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2121  integrase catalytic subunit  26.14 
 
 		 705 aa  54.7  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1279  integrase catalytic subunit  26.14 
 
 		 705 aa  54.7  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  24.86 
 
 		 468 aa  53.5  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3389  integrase catalytic subunit  26.2 
 
 		 689 aa  51.2  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  29.93 
 
 		 718 aa  50.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2405  integrase catalytic subunit  30.7 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000242595  decreased coverage  0.0000044189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0018  Integrase catalytic region  21.28 
 
 		 275 aa  50.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3397  Integrase catalytic region  21.28 
 
 		 275 aa  50.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6374  transposase Tn6049  30.7 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.038009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6335  transposase Tn6049  30.7 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000710666  hitchhiker  0.00105142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0321  integrase catalytic subunit  30.7 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2000  integrase catalytic subunit  30.7 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2008  integrase catalytic subunit  30.7 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160475  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3931  transposase Tn6049  30.7 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0145396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2552  integrase catalytic subunit  30.7 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.338431  normal  0.288762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2837  integrase catalytic subunit  30.7 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4424  transposase Tn6049  30.7 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0079465  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5480  transposase Tn6049  30.7 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3142  integrase catalytic subunit  30.7 
 
 		 479 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.943926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0458  integrase catalytic subunit  31.58 
 
 		 484 aa  48.9  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 		 536 aa  48.9  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0942  integrase catalytic subunit  31.58 
 
 		 484 aa  48.9  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1322  integrase catalytic subunit  31.58 
 
 		 484 aa  48.9  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1330  integrase catalytic subunit  31.58 
 
 		 484 aa  48.9  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2125  integrase catalytic subunit  31.58 
 
 		 484 aa  48.9  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1458  transposase  25.56 
 
 		 275 aa  49.3  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2853  integrase catalytic subunit  31.58 
 
 		 462 aa  48.9  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2273  integrase catalytic subunit  31.58 
 
 		 484 aa  48.9  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3076  Integrase catalytic region  26 
 
 		 257 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000625447 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  25.56 
 
 		 510 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  21.94 
 
 		 581 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 307 aa  47.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1305  integrase catalytic subunit  29.23 
 
 		 275 aa  47.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1653  integrase catalytic subunit  29.23 
 
 		 275 aa  47.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1711  integrase catalytic subunit  29.23 
 
 		 275 aa  47.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2285  integrase catalytic subunit  29.23 
 
 		 275 aa  47.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  22.88 
 
 		 480 aa  47.8  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  22.88 
 
 		 480 aa  47.8  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  22.68 
 
 		 662 aa  47.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 288 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3239  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 330 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  30.53 
 
 		 481 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 459 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 459 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4525  Mu DNA binding I gamma subdomain  23.48 
 
 		 656 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 459 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 459 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  32.26 
 
 		 493 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  25 
 
 		 296 aa  46.6  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  25 
 
 		 296 aa  46.6  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  25 
 
 		 296 aa  46.6  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0048  integrase  22.04 
 
 		 278 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  32.26 
 
 		 489 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  32.26 
 
 		 493 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  32.26 
 
 		 495 aa  46.2  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  28.57 
 
 		 306 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  28.57 
 
 		 307 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  28.57 
 
 		 307 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1737  putative transposase  32.97 
 
 		 276 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  28.57 
 
 		 306 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  28.57 
 
 		 306 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  32.09 
 
 		 552 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1540  transposase  29.67 
 
 		 239 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0252  putative bacteriophage DNA transposition protein A  24.26 
 
 		 372 aa  46.2  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  29.77 
 
 		 481 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  34.41 
 
 		 341 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  29.67 
 
 		 441 aa  45.8  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  29.67 
 
 		 441 aa  45.8  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  29.67 
 
 		 441 aa  45.8  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  29.67 
 
 		 441 aa  45.8  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1304  Integrase catalytic region  28.57 
 
 		 258 aa  45.8  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06969  hypothetical protein  26.76 
 
 		 487 aa  45.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 547 aa  45.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 325 aa  45.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2545  Integrase catalytic region  24.45 
 
 		 829 aa  45.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000108599  hitchhiker  0.00117981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0787  transposase  29.17 
 
 		 667 aa  44.7  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000128606  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0650  transposase  29.17 
 
 		 667 aa  44.7  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0686157  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  26.37 
 
 		 275 aa  44.7  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2432  Integrase catalytic region  27.47 
 
 		 236 aa  43.9  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>