50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3389 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3389  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 689 aa  1421    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  24.73 
 
 		 665 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1264  Transposase-like Mu  24.68 
 
 		 728 aa  87  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000119608 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  27.86 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  27.86 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  27.86 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  23.78 
 
 		 708 aa  75.1  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  23.19 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  23.19 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0216  transposase  23.68 
 
 		 684 aa  62.4  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  26.64 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  23.75 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  26.17 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  22.87 
 
 		 581 aa  58.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0411  Integrase catalytic region  24.93 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00539616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  23.23 
 
 		 417 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  23.66 
 
 		 417 aa  55.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  23.5 
 
 		 670 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  23.66 
 
 		 417 aa  55.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  24.08 
 
 		 567 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  25.86 
 
 		 710 aa  55.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  24.69 
 
 		 810 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  23.87 
 
 		 555 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  24.41 
 
 		 663 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4525  Mu DNA binding I gamma subdomain  22.28 
 
 		 656 aa  53.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  25.37 
 
 		 560 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2907  integrase catalytic subunit  26.2 
 
 		 736 aa  52  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341428  normal  0.384956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  24.37 
 
 		 558 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2654  transposase, putative  22.87 
 
 		 669 aa  51.2  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4119  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 736 aa  50.8  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000332444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  24.37 
 
 		 558 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0713  Transposase-like Mu  25.16 
 
 		 732 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  24.64 
 
 		 561 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  23.83 
 
 		 416 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  23.03 
 
 		 469 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  24.85 
 
 		 772 aa  50.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2955  prophage MuMc02, transposase protein A, putative  23 
 
 		 709 aa  48.9  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456308  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  21.85 
 
 		 688 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  21.32 
 
 		 618 aa  46.2  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  21.32 
 
 		 618 aa  46.2  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  25.81 
 
 		 560 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  21.61 
 
 		 738 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  22.84 
 
 		 649 aa  45.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  22.77 
 
 		 738 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3035  transposase protein  21.43 
 
 		 690 aa  45.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277466  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0100  putative transposase  21.81 
 
 		 627 aa  44.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.733769 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  23.16 
 
 		 541 aa  44.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  23.16 
 
 		 541 aa  44.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  23.16 
 
 		 541 aa  44.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  23.16 
 
 		 541 aa  44.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>