111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4214 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  100 
 
 
665 aa  1378    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3389  integrase catalytic subunit  24.46 
 
 
689 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  28.12 
 
 
688 aa  107  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4525  Mu DNA binding I gamma subdomain  26.17 
 
 
656 aa  107  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  23.76 
 
 
708 aa  104  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1279  integrase catalytic subunit  30 
 
 
705 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2121  integrase catalytic subunit  30 
 
 
705 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1264  Transposase-like Mu  26.59 
 
 
728 aa  100  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000119608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3035  transposase protein  27.53 
 
 
690 aa  99  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277466  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  24.86 
 
 
558 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  25.33 
 
 
662 aa  92  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2654  transposase, putative  25.94 
 
 
669 aa  91.3  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  24.86 
 
 
558 aa  90.9  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  27.2 
 
 
560 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  26.64 
 
 
561 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  24.35 
 
 
480 aa  88.6  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  24.35 
 
 
480 aa  88.6  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0650  transposase  27.09 
 
 
667 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0686157  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0787  transposase  27.09 
 
 
667 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000128606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  25.11 
 
 
581 aa  84  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0216  transposase  27.35 
 
 
684 aa  81.3  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  24.5 
 
 
555 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  24.85 
 
 
497 aa  78.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  24.85 
 
 
497 aa  78.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  24.85 
 
 
497 aa  78.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  25.26 
 
 
724 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  24.82 
 
 
671 aa  74.3  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  27.01 
 
 
567 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  25.74 
 
 
468 aa  72  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  25.65 
 
 
663 aa  71.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0713  Transposase-like Mu  24.1 
 
 
732 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  23.88 
 
 
481 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  22.14 
 
 
481 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  24.58 
 
 
718 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0252  putative bacteriophage DNA transposition protein A  26.97 
 
 
372 aa  64.3  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2907  integrase catalytic subunit  25.77 
 
 
736 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341428  normal  0.384956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4119  integrase catalytic subunit  25.23 
 
 
736 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000332444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  24.51 
 
 
556 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  24.51 
 
 
556 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  24.51 
 
 
556 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  24.51 
 
 
556 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  22.77 
 
 
670 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0117  integrase catalytic subunit  22.93 
 
 
614 aa  57.4  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145881  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0243  integrase catalytic subunit  22.93 
 
 
614 aa  57.4  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00837519  hitchhiker  0.00531569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2451  integrase catalytic subunit  22.93 
 
 
614 aa  57.4  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0255149  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1426  hypothetical protein  26.88 
 
 
801 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  29.3 
 
 
907 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  24.55 
 
 
772 aa  54.3  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  23.91 
 
 
738 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  38.04 
 
 
341 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  23.6 
 
 
738 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  20.83 
 
 
618 aa  52  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3184  TnsA endonuclease  23.62 
 
 
902 aa  52  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  24.55 
 
 
626 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2955  prophage MuMc02, transposase protein A, putative  23.13 
 
 
709 aa  49.7  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  25.17 
 
 
426 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0100  putative transposase  25.73 
 
 
627 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.733769 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  25 
 
 
552 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2993  Transposase-like Mu  22.05 
 
 
677 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  28.21 
 
 
900 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  28.21 
 
 
900 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  21.88 
 
 
489 aa  47.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1983  TnsA endonuclease  22.66 
 
 
886 aa  47.8  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.176363 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  24.9 
 
 
296 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  30.91 
 
 
296 aa  47.4  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  30.91 
 
 
296 aa  47.4  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  28.37 
 
 
551 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  34.34 
 
 
902 aa  46.6  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  25.42 
 
 
595 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  22.4 
 
 
536 aa  45.8  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0067  integrase catalytic subunit  22 
 
 
905 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0193  integrase catalytic subunit  22 
 
 
905 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.952164  hitchhiker  0.00648226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1330  integrase catalytic subunit  22 
 
 
905 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1715  integrase catalytic subunit  22 
 
 
905 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4946  integrase catalytic subunit  22 
 
 
905 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  24.77 
 
 
245 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 
393 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 
390 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 
390 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  30.86 
 
 
390 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  29.47 
 
 
308 aa  45.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  29.79 
 
 
382 aa  45.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2432  Integrase catalytic region  29.03 
 
 
236 aa  45.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  21.99 
 
 
810 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0458  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
484 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0942  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
484 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1322  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
484 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1330  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
484 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2125  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
484 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2273  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
484 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2853  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
462 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  29.79 
 
 
382 aa  44.3  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  23.56 
 
 
541 aa  44.3  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  23.56 
 
 
541 aa  44.3  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  23.56 
 
 
541 aa  44.3  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  23.56 
 
 
541 aa  44.3  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1666  transposase IS3/IS911 family protein  29.79 
 
 
382 aa  44.3  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  29.79 
 
 
382 aa  44.3  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  29.79 
 
 
382 aa  44.3  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  29.79 
 
 
382 aa  44.3  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>