More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3934 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  99.74 
 
 		 393 aa  816    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 390 aa  817    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 390 aa  817    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 390 aa  817    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  41.04 
 
 		 379 aa  275  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04112  hypothetical protein  47.25 
 
 		 294 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  45.36 
 
 		 286 aa  246  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1312  ISSd1, transposase orfB  47.58 
 
 		 272 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  45.65 
 
 		 274 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04149  IS600 ORF2-like protein  47.21 
 
 		 272 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0735  integrase catalytic region  47.21 
 
 		 272 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0021  ISSd1, transposase orfB  47.21 
 
 		 272 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  44.24 
 
 		 270 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  44.24 
 
 		 270 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3409  integrase catalytic region  46.47 
 
 		 272 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  45.11 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  45.11 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  44.24 
 
 		 270 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  44.24 
 
 		 270 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  44.24 
 
 		 270 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  45.11 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  44.24 
 
 		 270 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  45.11 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  45.11 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  44.24 
 
 		 270 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2040  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  238  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2939  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0263  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0242  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0902  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0897  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0999  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00251682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2182  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0788896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4403  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1364  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1660  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2035  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1713  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2078  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2112  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2144  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2191  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000560524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1008  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4657  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.326182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4367  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3958  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1278  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1599  ISSd1, transposase orfB  46.47 
 
 		 272 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000676814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  43.84 
 
 		 275 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0402  Integrase catalytic region  45.11 
 
 		 281 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.992853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1089  Integrase catalytic region  44.07 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1013  integrase catalytic subunit  52.16 
 
 		 232 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0138  IS3 family element, transposase orfB  45.35 
 
 		 272 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 286 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  41.22 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  41.22 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  41.22 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  41.22 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  41.94 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  41.94 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1315  integrase catalytic subunit  44.07 
 
 		 284 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1120  integrase catalytic subunit  44.07 
 
 		 284 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1053  integrase catalytic subunit  44.07 
 
 		 284 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1028  integrase catalytic subunit  44.07 
 
 		 284 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0731  integrase catalytic subunit  44.07 
 
 		 284 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.100278  decreased coverage  0.000000433601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1024  integrase catalytic subunit  44.07 
 
 		 284 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  42.22 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1476  integrase catalytic subunit  44.07 
 
 		 284 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.725105  normal  0.179126 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1356  integrase catalytic subunit  44.07 
 
 		 284 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278768 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1347  IS3 putative transposase  40.77 
 
 		 290 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  42.39 
 
 		 289 aa  220  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3806  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 293 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1614  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 293 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2971  integrase catalytic region  41.92 
 
 		 293 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43279 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1393  Integrase catalytic region  44.87 
 
 		 271 aa  219  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2887  Integrase catalytic region  44.87 
 
 		 271 aa  219  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3769  putative transposase  39.93 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  40.56 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  40.56 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09750  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.52 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40520  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.52 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41860  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.52 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16550  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.52 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  42.03 
 
 		 289 aa  215  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20540  Integrase, catalytic domain-containing protein  40.52 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 280 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  42.59 
 
 		 280 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>