47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1264 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  47.08 
 
 		 708 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1264  Transposase-like Mu  100 
 
 		 728 aa  1493    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000119608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0713  Transposase-like Mu  26.37 
 
 		 732 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  26.59 
 
 		 665 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  25.91 
 
 		 738 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  25.45 
 
 		 738 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3389  integrase catalytic subunit  24.68 
 
 		 689 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  26.91 
 
 		 688 aa  80.9  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  25.86 
 
 		 671 aa  79.7  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0216  transposase  24.51 
 
 		 684 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1613  hypothetical protein  26.91 
 
 		 667 aa  76.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.564191  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3035  transposase protein  26.86 
 
 		 690 aa  75.1  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4525  Mu DNA binding I gamma subdomain  25.45 
 
 		 656 aa  73.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4119  integrase catalytic subunit  25.5 
 
 		 736 aa  72  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000332444 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0411  Integrase catalytic region  23.49 
 
 		 551 aa  71.2  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00539616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  27.82 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  27.82 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  27.82 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  25.95 
 
 		 416 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2907  integrase catalytic subunit  23.34 
 
 		 736 aa  69.3  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341428  normal  0.384956 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  25.29 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  25.29 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  25.29 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0100  putative transposase  26.34 
 
 		 627 aa  62.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.733769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1279  integrase catalytic subunit  28.33 
 
 		 705 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2121  integrase catalytic subunit  28.33 
 
 		 705 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  23.51 
 
 		 715 aa  57.4  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  25.57 
 
 		 718 aa  57.4  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  25.97 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  24.96 
 
 		 662 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  23.62 
 
 		 441 aa  52.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  23.62 
 
 		 441 aa  52.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  23.62 
 
 		 441 aa  52.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  23.62 
 
 		 441 aa  52.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  24.75 
 
 		 625 aa  52.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  22.35 
 
 		 772 aa  52  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2654  transposase, putative  24.83 
 
 		 669 aa  51.2  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  33.98 
 
 		 341 aa  51.2  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0212  integrase catalytic subunit  24.71 
 
 		 1010 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0650  transposase  26.38 
 
 		 667 aa  50.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0686157  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2895  integrase catalytic subunit  24.71 
 
 		 976 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0787  transposase  26.38 
 
 		 667 aa  50.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000128606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1226  hypothetical protein  58.54 
 
 		 41 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00108215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  30.4 
 
 		 426 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0252  putative bacteriophage DNA transposition protein A  24.06 
 
 		 372 aa  47  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4430  hypothetical protein  25.39 
 
 		 876 aa  46.6  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0564261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  24.05 
 
 		 907 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>