24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2654 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0650  transposase  66.47 
 
 		 667 aa  932    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0686157  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0787  transposase  66.47 
 
 		 667 aa  932    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000128606  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2654  transposase, putative  100 
 
 		 669 aa  1407    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  47.31 
 
 		 662 aa  618  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4525  Mu DNA binding I gamma subdomain  37.8 
 
 		 656 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  34.62 
 
 		 671 aa  363  8e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  37.44 
 
 		 688 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3035  transposase protein  35.36 
 
 		 690 aa  316  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277466  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1279  integrase catalytic subunit  34.12 
 
 		 705 aa  296  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2121  integrase catalytic subunit  34.12 
 
 		 705 aa  296  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0100  putative transposase  28.34 
 
 		 627 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.733769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  25.94 
 
 		 665 aa  91.3  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0216  transposase  21.75 
 
 		 684 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2562  putative cytoplasmic protein  48.21 
 
 		 124 aa  54.3  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2615  hypothetical protein  48.21 
 
 		 124 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2603  putative cytoplasmic protein  48.21 
 
 		 124 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.715844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2515  putative cytoplasmic protein  48.21 
 
 		 124 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2726  hypothetical protein  48.21 
 
 		 124 aa  54.3  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4119  integrase catalytic subunit  21.05 
 
 		 736 aa  53.9  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000332444 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1264  Transposase-like Mu  24.83 
 
 		 728 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000119608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2907  integrase catalytic subunit  23.1 
 
 		 736 aa  51.2  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341428  normal  0.384956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3389  integrase catalytic subunit  22.9 
 
 		 689 aa  50.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  22.31 
 
 		 708 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0713  Transposase-like Mu  23.08 
 
 		 732 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>