33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3035 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  82.17 
 
 		 688 aa  1175    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3035  transposase protein  100 
 
 		 690 aa  1426    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4525  Mu DNA binding I gamma subdomain  41.69 
 
 		 656 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  40.97 
 
 		 671 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2121  integrase catalytic subunit  38.55 
 
 		 705 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1279  integrase catalytic subunit  38.55 
 
 		 705 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2654  transposase, putative  35.36 
 
 		 669 aa  323  7e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  32.59 
 
 		 662 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0650  transposase  33.39 
 
 		 667 aa  293  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0686157  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0787  transposase  33.39 
 
 		 667 aa  293  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000128606  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0100  putative transposase  28.46 
 
 		 627 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.733769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  26.68 
 
 		 665 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  27.11 
 
 		 708 aa  87.4  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1264  Transposase-like Mu  26.86 
 
 		 728 aa  75.1  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000119608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0713  Transposase-like Mu  22.13 
 
 		 732 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  23.97 
 
 		 772 aa  60.8  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1565  hypothetical protein  24.79 
 
 		 669 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191847 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2907  integrase catalytic subunit  24.16 
 
 		 736 aa  57.4  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341428  normal  0.384956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4119  integrase catalytic subunit  23.37 
 
 		 736 aa  57  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000332444 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0411  Integrase catalytic region  23.16 
 
 		 551 aa  53.9  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00539616  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  22.41 
 
 		 663 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  23.62 
 
 		 810 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  26.26 
 
 		 497 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  26.26 
 
 		 497 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  26.26 
 
 		 497 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0270  bacteriophage DNA transposition protein A, putative  27.52 
 
 		 690 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.513793  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  22.17 
 
 		 468 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  21.28 
 
 		 618 aa  45.8  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  28.57 
 
 		 902 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0216  transposase  25.07 
 
 		 684 aa  45.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  23.65 
 
 		 724 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3389  integrase catalytic subunit  21.01 
 
 		 689 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  26.58 
 
 		 548 aa  44.3  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>