53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0270 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0270  bacteriophage DNA transposition protein A, putative  100 
 
 		 690 aa  1406    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.513793  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0252  putative bacteriophage DNA transposition protein A  31.9 
 
 		 372 aa  128  4.0000000000000003e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  29.06 
 
 		 718 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  26.48 
 
 		 772 aa  99.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  25.62 
 
 		 724 aa  88.6  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2955  prophage MuMc02, transposase protein A, putative  22.75 
 
 		 709 aa  81.6  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456308  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  22.16 
 
 		 715 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  28.76 
 
 		 738 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  28.76 
 
 		 738 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  22.7 
 
 		 617 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  22.66 
 
 		 617 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  33.54 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  30.13 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0411  Integrase catalytic region  24.15 
 
 		 551 aa  61.6  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00539616  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  31.55 
 
 		 630 aa  57.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  24.46 
 
 		 560 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  26.8 
 
 		 663 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  20.81 
 
 		 497 aa  54.3  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  20.81 
 
 		 497 aa  54.3  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  20.81 
 
 		 497 aa  54.3  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  36.62 
 
 		 791 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  21.67 
 
 		 653 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  21.95 
 
 		 558 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  26 
 
 		 618 aa  51.6  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  26 
 
 		 618 aa  51.6  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  29.87 
 
 		 626 aa  51.2  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  21.76 
 
 		 558 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  22.45 
 
 		 481 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  22.61 
 
 		 481 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0977  Transposase-like Mu  24.67 
 
 		 561 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  22.71 
 
 		 581 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  23.38 
 
 		 468 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1990  Integrase catalytic region  29.05 
 
 		 481 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1894  Integrase catalytic region  25.15 
 
 		 666 aa  48.5  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1116  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding  26.8 
 
 		 721 aa  47.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  24.17 
 
 		 688 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  43.28 
 
 		 322 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4359  integrase catalytic subunit  27.31 
 
 		 690 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3935  putative transposase  27.39 
 
 		 697 aa  47.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  23.23 
 
 		 541 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  23.23 
 
 		 541 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5369  Integrase catalytic region  22.53 
 
 		 907 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295571 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  23.23 
 
 		 541 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  23.23 
 
 		 541 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2545  Integrase catalytic region  32.35 
 
 		 829 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000108599  hitchhiker  0.00117981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3035  transposase protein  27.52 
 
 		 690 aa  45.8  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277466  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  22.84 
 
 		 614 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  28.79 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  28.79 
 
 		 417 aa  44.7  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  28.79 
 
 		 417 aa  44.7  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  28.79 
 
 		 416 aa  44.3  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  21.31 
 
 		 480 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  21.31 
 
 		 480 aa  44.3  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>