32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1990 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1990  Integrase catalytic region  100 
 
 		 481 aa  994    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1894  Integrase catalytic region  48.33 
 
 		 666 aa  432  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  27.49 
 
 		 718 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  29.8 
 
 		 724 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  29.33 
 
 		 481 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  29.33 
 
 		 481 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  26.24 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  32.31 
 
 		 468 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  26.95 
 
 		 547 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  26.3 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  26.3 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  26.3 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  24.75 
 
 		 556 aa  51.2  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  24.75 
 
 		 556 aa  51.2  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  24.75 
 
 		 556 aa  50.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  24.75 
 
 		 556 aa  51.2  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  25.49 
 
 		 480 aa  50.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  25.49 
 
 		 480 aa  50.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0252  putative bacteriophage DNA transposition protein A  28.19 
 
 		 372 aa  50.4  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  22.89 
 
 		 552 aa  50.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0270  bacteriophage DNA transposition protein A, putative  29.05 
 
 		 690 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.513793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  25.86 
 
 		 276 aa  47.8  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  28.95 
 
 		 382 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  23.5 
 
 		 738 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  22.81 
 
 		 738 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  29.46 
 
 		 497 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  29.46 
 
 		 497 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  29.46 
 
 		 497 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  25.29 
 
 		 560 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  25.2 
 
 		 554 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  26.06 
 
 		 536 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  27.45 
 
 		 426 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>