119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2545 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2545  Integrase catalytic region  100 
 
 		 829 aa  1654    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000108599  hitchhiker  0.00117981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0613  integrase catalytic subunit  45.37 
 
 		 634 aa  425  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.514295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3183  integrase catalytic subunit  45.37 
 
 		 634 aa  425  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0522653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3222  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 		 539 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196436  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2020  hypothetical protein  37.26 
 
 		 560 aa  342  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  29.28 
 
 		 715 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  29.28 
 
 		 715 aa  206  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0496  integrase  33.59 
 
 		 523 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3575  hypothetical protein  30.16 
 
 		 757 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.164983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  26.37 
 
 		 749 aa  147  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0882  hypothetical protein  27.37 
 
 		 628 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  24.93 
 
 		 754 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  27.57 
 
 		 636 aa  76.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  23.26 
 
 		 618 aa  73.9  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  26.44 
 
 		 810 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  24.29 
 
 		 721 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  25.61 
 
 		 548 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  25.65 
 
 		 554 aa  62.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  23.3 
 
 		 704 aa  62.4  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  26.67 
 
 		 560 aa  62  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  25.62 
 
 		 562 aa  62  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  31.09 
 
 		 718 aa  62.4  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  25.62 
 
 		 509 aa  62  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  25.62 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  23.64 
 
 		 617 aa  60.8  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  25.48 
 
 		 536 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  23.58 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  21.74 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  21.74 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  21.74 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  25.56 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  25.08 
 
 		 724 aa  58.9  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  23.42 
 
 		 617 aa  58.9  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  23.01 
 
 		 710 aa  58.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  24.84 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  23.64 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  23.64 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  23.64 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  22.55 
 
 		 626 aa  57.8  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4506  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 560 aa  57.4  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  22.51 
 
 		 459 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  22.51 
 
 		 459 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06219  hypothetical protein  32.32 
 
 		 333 aa  57.4  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  23.64 
 
 		 416 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  23.66 
 
 		 630 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  24.02 
 
 		 653 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3220  hypothetical protein  47.73 
 
 		 172 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112254  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  25.37 
 
 		 493 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  25.37 
 
 		 493 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2088  hypothetical protein  25.93 
 
 		 749 aa  55.5  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  26.11 
 
 		 510 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  25.37 
 
 		 489 aa  55.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  23.86 
 
 		 556 aa  54.7  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  23.86 
 
 		 556 aa  54.7  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  23.86 
 
 		 556 aa  54.7  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  23.86 
 
 		 556 aa  54.7  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  26.15 
 
 		 733 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  27.54 
 
 		 422 aa  54.7  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0571  integrase catalytic subunit  25.62 
 
 		 499 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1688  integrase catalytic subunit  25.62 
 
 		 499 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2501  integrase catalytic subunit  25.62 
 
 		 499 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2928  integrase catalytic subunit  25.62 
 
 		 499 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171579  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  21.99 
 
 		 459 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  28.36 
 
 		 469 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  22.49 
 
 		 581 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 618 aa  53.5  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 618 aa  53.5  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  25.14 
 
 		 791 aa  53.5  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  35.87 
 
 		 662 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  35.87 
 
 		 662 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  21.99 
 
 		 459 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  25.87 
 
 		 495 aa  53.5  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  35.87 
 
 		 575 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  22.05 
 
 		 900 aa  52.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  22.05 
 
 		 900 aa  52.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  22.83 
 
 		 677 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  25.33 
 
 		 649 aa  51.6  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  25.35 
 
 		 341 aa  51.2  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  22.83 
 
 		 652 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  22.83 
 
 		 652 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  22.83 
 
 		 652 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  21.94 
 
 		 567 aa  51.2  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2955  prophage MuMc02, transposase protein A, putative  22.49 
 
 		 709 aa  50.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  21.2 
 
 		 651 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  20.4 
 
 		 625 aa  50.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  27.82 
 
 		 547 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  24.38 
 
 		 522 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3873  Integrase catalytic region  25.57 
 
 		 960 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3214  hypothetical protein  30.39 
 
 		 780 aa  48.9  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  23.02 
 
 		 441 aa  48.1  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  23.02 
 
 		 441 aa  48.1  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  23.02 
 
 		 441 aa  48.1  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  23.02 
 
 		 441 aa  48.1  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0212  integrase catalytic subunit  21.74 
 
 		 1010 aa  47.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3239  integrase catalytic subunit  25.81 
 
 		 330 aa  47.8  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2895  integrase catalytic subunit  21.74 
 
 		 976 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>