93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3214 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3214  hypothetical protein  100 
 
 		 780 aa  1616    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  30.23 
 
 		 704 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3210  integrase catalytic subunit  27.03 
 
 		 782 aa  162  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  28.05 
 
 		 710 aa  149  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1426  hypothetical protein  27.69 
 
 		 801 aa  137  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2538  hypothetical protein  24.09 
 
 		 762 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  24.04 
 
 		 754 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1192  integrase, catalytic region  25.94 
 
 		 740 aa  110  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2088  hypothetical protein  20.44 
 
 		 749 aa  106  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  25.37 
 
 		 810 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3542  hypothetical protein  28.48 
 
 		 689 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  22.57 
 
 		 774 aa  89.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  25.26 
 
 		 547 aa  87.4  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  24.08 
 
 		 721 aa  82.4  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  22.85 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  23.75 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  23.75 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  23.75 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  23.75 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  24.19 
 
 		 653 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  25.07 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  25.07 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  25.07 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  25.07 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  21.99 
 
 		 552 aa  73.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4288  integrase catalytic subunit  24.09 
 
 		 547 aa  70.1  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167614  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  22.57 
 
 		 618 aa  70.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  25.42 
 
 		 599 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  25.42 
 
 		 599 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  21.65 
 
 		 551 aa  69.3  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06969  hypothetical protein  26.25 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  23.49 
 
 		 652 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  23.49 
 
 		 652 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  23.49 
 
 		 652 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  23.49 
 
 		 677 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  26.62 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0028  transposase  25.89 
 
 		 651 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.680566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2267  integrase catalytic region  23.61 
 
 		 626 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102456 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5056  integrase catalytic region  26.64 
 
 		 575 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5218  integrase catalytic subunit  26.64 
 
 		 662 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.250569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3150  integrase catalytic subunit  26.64 
 
 		 662 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  22.9 
 
 		 617 aa  64.7  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  26.19 
 
 		 562 aa  64.7  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  26.19 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  26.19 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  22.9 
 
 		 617 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  26.57 
 
 		 536 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  25.85 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0202  Integrase catalytic region  28.65 
 
 		 630 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  23.97 
 
 		 782 aa  61.6  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2936  TniA transposase  23.38 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1680  TniA transposase  23.38 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0125  hypothetical protein  24.83 
 
 		 625 aa  60.8  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1702  hypothetical protein  25.84 
 
 		 650 aa  60.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1580  hypothetical protein  22.82 
 
 		 640 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3039  integrase catalytic subunit  24.73 
 
 		 614 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.532754  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4394  integrase catalytic subunit  25.62 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  29.63 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0058  transposase  26.88 
 
 		 595 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  28.08 
 
 		 785 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  22.43 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4980  TniA transposase  23.67 
 
 		 640 aa  57.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.01794 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  19.28 
 
 		 636 aa  57  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  22.62 
 
 		 481 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  23.71 
 
 		 791 aa  55.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2524  TniA transposase  23.19 
 
 		 632 aa  54.7  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2505  transposon transposition protein B, putative  22.34 
 
 		 626 aa  53.9  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2235  integrase catalytic region  22.91 
 
 		 644 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.986822  decreased coverage  0.00107006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  31.93 
 
 		 749 aa  51.6  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  26.09 
 
 		 670 aa  51.2  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  23.92 
 
 		 554 aa  50.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  18.88 
 
 		 480 aa  50.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  18.88 
 
 		 480 aa  50.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  28.35 
 
 		 567 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2545  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 829 aa  48.5  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000108599  hitchhiker  0.00117981 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0178  hypothetical protein  24.56 
 
 		 659 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00166978  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0284  hypothetical protein  24.56 
 
 		 659 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1590  integrase catalytic subunit  23.58 
 
 		 618 aa  48.1  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0693  integrase catalytic subunit  23.58 
 
 		 618 aa  48.1  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.658571  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1859  hypothetical protein  24.27 
 
 		 435 aa  47.8  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  21.79 
 
 		 900 aa  47.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  21.79 
 
 		 900 aa  47.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  21.78 
 
 		 497 aa  47.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4688  integrase catalytic subunit  22.98 
 
 		 382 aa  47  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.03329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  29.85 
 
 		 555 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0613  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 634 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.514295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2602  hypothetical protein  24.1 
 
 		 733 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0193648  normal  0.873039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  24.5 
 
 		 560 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3183  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 634 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0522653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3222  integrase catalytic subunit  28.43 
 
 		 539 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196436  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0151  hypothetical protein  23.32 
 
 		 456 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  22.74 
 
 		 616 aa  45.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5778  integrase catalytic region  25.09 
 
 		 662 aa  45.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>