28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2020 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2020  hypothetical protein  100 
 
 		 560 aa  1110    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3222  integrase catalytic subunit  52.42 
 
 		 539 aa  537  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196436  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0613  integrase catalytic subunit  56.72 
 
 		 634 aa  528  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.514295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3183  integrase catalytic subunit  56.72 
 
 		 634 aa  528  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0522653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2545  Integrase catalytic region  37.26 
 
 		 829 aa  353  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000108599  hitchhiker  0.00117981 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  27.62 
 
 		 715 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  27.62 
 
 		 715 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0496  integrase  33.79 
 
 		 523 aa  145  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3575  hypothetical protein  29.57 
 
 		 757 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.164983 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  23.96 
 
 		 749 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0882  hypothetical protein  29.57 
 
 		 628 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0220  Integrase catalytic region  20.97 
 
 		 618 aa  71.2  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.611763  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3220  hypothetical protein  55 
 
 		 172 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112254  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  24.42 
 
 		 649 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4740  integrase catalytic region  23.64 
 
 		 902 aa  50.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  26.47 
 
 		 560 aa  50.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  25.82 
 
 		 562 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  25.82 
 
 		 572 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  25.82 
 
 		 509 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3579  Integrase catalytic region  27.55 
 
 		 554 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.318948  normal  0.0294247 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3258  integrase catalytic subunit  25.6 
 
 		 599 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4905  integrase catalytic subunit  25.6 
 
 		 599 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4577  Integrase catalytic region  23.69 
 
 		 900 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3504  Integrase catalytic region  23.69 
 
 		 900 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  24.53 
 
 		 552 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  25.71 
 
 		 542 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  23.35 
 
 		 810 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  23.49 
 
 		 636 aa  45.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>