69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4525 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4525  Mu DNA binding I gamma subdomain  100 
 
 
656 aa  1327    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3035  transposase protein  42.11 
 
 
690 aa  448  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277466  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2121  integrase catalytic subunit  43.29 
 
 
705 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1279  integrase catalytic subunit  43.29 
 
 
705 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3068  transposase protein  41.18 
 
 
688 aa  445  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  40.89 
 
 
671 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2654  transposase, putative  35.48 
 
 
669 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0787  transposase  35.94 
 
 
667 aa  365  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000128606  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0650  transposase  35.94 
 
 
667 aa  365  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0686157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  33.93 
 
 
662 aa  335  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0100  putative transposase  30.32 
 
 
627 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.733769 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4214  Transposase-like Mu  26.17 
 
 
665 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.497688  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3350  bacteriophage transposase A protein, putative  27.02 
 
 
708 aa  105  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1264  Transposase-like Mu  24.92 
 
 
728 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000119608 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0216  transposase  25.27 
 
 
684 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  24.32 
 
 
663 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  23.61 
 
 
556 aa  56.6  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  23.61 
 
 
556 aa  56.6  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  23.61 
 
 
556 aa  56.6  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  23.61 
 
 
556 aa  56.6  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  23.76 
 
 
541 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  23.76 
 
 
541 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  23.76 
 
 
541 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3389  integrase catalytic subunit  22.28 
 
 
689 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  23.76 
 
 
541 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  27.22 
 
 
480 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  27.22 
 
 
480 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  23.18 
 
 
551 aa  52  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  23.42 
 
 
497 aa  51.2  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  23.42 
 
 
497 aa  51.2  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  23.42 
 
 
497 aa  51.2  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4236  plasmid replication initiator protein-like protein  23.77 
 
 
548 aa  50.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.754905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1565  hypothetical protein  22.18 
 
 
669 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  23.34 
 
 
718 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4119  integrase catalytic subunit  25 
 
 
736 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000332444 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0377  integrase catalytic subunit  23.74 
 
 
636 aa  46.2  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.893985  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  23.88 
 
 
296 aa  46.6  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  23.88 
 
 
296 aa  46.2  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  23.88 
 
 
296 aa  46.6  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08181  transposase  25.58 
 
 
191 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000543405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2575  integrase catalytic region  27.59 
 
 
290 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196257  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2563  integrase catalytic region  27.59 
 
 
290 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  hitchhiker  0.0000085301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2907  integrase catalytic subunit  23.48 
 
 
736 aa  46.2  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341428  normal  0.384956 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01092  hypothetical protein  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06561  integrase  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06183  integrase  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06080  hypothetical protein  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06014  hypothetical protein  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05750  integrase  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05658  integrase  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08185  integrase, catalytic region  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000144763  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01503  hypothetical protein  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01668  hypothetical protein  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01864  hypothetical protein  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01946  hypothetical protein  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02412  hypothetical protein  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02438  hypothetical protein  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02813  hypothetical protein  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02886  hypothetical protein  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05650  integrase  27.59 
 
 
233 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02327  hypothetical protein  27.59 
 
 
172 aa  45.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05621  hypothetical protein  25.83 
 
 
233 aa  44.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1613  hypothetical protein  22.47 
 
 
667 aa  44.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.564191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02148  hypothetical protein  27.59 
 
 
217 aa  44.3  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00699  hypothetical protein  27.59 
 
 
222 aa  44.3  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05742  hypothetical protein  27.59 
 
 
208 aa  44.3  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1150  integrase catalytic subunit  22.11 
 
 
560 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.204343 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  26.83 
 
 
307 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  28.05 
 
 
245 aa  44.3  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>