More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06183 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06080  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06014  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05750  integrase  100 
 
 
233 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05658  integrase  100 
 
 
233 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06561  integrase  99.57 
 
 
233 aa  486  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06183  integrase  100 
 
 
233 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02438  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02813  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08185  integrase, catalytic region  99.57 
 
 
233 aa  486  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000144763  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02412  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01668  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01503  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01946  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01864  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02886  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05621  hypothetical protein  99.57 
 
 
233 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05650  integrase  99.57 
 
 
233 aa  485  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01092  hypothetical protein  99.57 
 
 
233 aa  485  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00699  hypothetical protein  99.55 
 
 
222 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2563  integrase catalytic region  90.99 
 
 
290 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  hitchhiker  0.0000085301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2575  integrase catalytic region  90.99 
 
 
290 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196257  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02148  hypothetical protein  99.03 
 
 
217 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05742  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08181  transposase  97.34 
 
 
191 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000543405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02327  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  360  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1458  transposase  61.33 
 
 
275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43118  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  58.77 
 
 
275 aa  295  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0083  integrase catalytic subunit  62.72 
 
 
262 aa  290  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0292  integrase catalytic subunit  62.72 
 
 
262 aa  290  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1325  integrase catalytic subunit  62.72 
 
 
262 aa  290  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00777894  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0977  integrase catalytic subunit  62.72 
 
 
262 aa  290  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.231813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  58.7 
 
 
293 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4375  integrase catalytic subunit  59.11 
 
 
276 aa  285  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  57.33 
 
 
296 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  57.33 
 
 
296 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  57.33 
 
 
296 aa  280  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  55.56 
 
 
325 aa  280  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0184  Integrase catalytic region  54.42 
 
 
308 aa  280  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.755567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0135  Integrase catalytic region  54.42 
 
 
308 aa  280  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1880  Integrase catalytic region  54.42 
 
 
308 aa  280  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  54.42 
 
 
308 aa  280  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  58.93 
 
 
245 aa  278  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1737  putative transposase  53.1 
 
 
276 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0048  integrase  55.75 
 
 
278 aa  274  8e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  57.08 
 
 
276 aa  273  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0018  Integrase catalytic region  56.9 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3397  Integrase catalytic region  56.9 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  53.78 
 
 
307 aa  272  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  53.78 
 
 
307 aa  272  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  53.78 
 
 
306 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  53.78 
 
 
307 aa  271  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  53.78 
 
 
288 aa  271  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  53.33 
 
 
306 aa  271  9e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  53.33 
 
 
306 aa  271  9e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5938  integrase catalytic subunit  53.98 
 
 
276 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1305  integrase catalytic subunit  51.72 
 
 
275 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1653  integrase catalytic subunit  51.72 
 
 
275 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99187  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1711  integrase catalytic subunit  51.72 
 
 
275 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2285  integrase catalytic subunit  51.72 
 
 
275 aa  267  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2229  integrase catalytic subunit  56.44 
 
 
290 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2432  Integrase catalytic region  64.06 
 
 
236 aa  263  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1540  transposase  64.71 
 
 
239 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1304  Integrase catalytic region  54.87 
 
 
258 aa  248  5e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1145  integrase catalytic subunit  53.12 
 
 
280 aa  245  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.631339  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3076  Integrase catalytic region  53.52 
 
 
257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000625447 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0996  integrase, catalytic region  51.33 
 
 
295 aa  244  9e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2623  transposase IS3/IS911 family protein  52.89 
 
 
369 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.730689  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2025  transposase IS3/IS911 family protein  52.89 
 
 
369 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.40416  normal  0.768967 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  51.54 
 
 
305 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  48.25 
 
 
278 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0772  Integrase catalytic region  48.02 
 
 
279 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0879  Integrase catalytic region  48.02 
 
 
279 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.655608 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2413  Integrase catalytic region  48.02 
 
 
279 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  47.81 
 
 
278 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2322  Integrase catalytic region  48.46 
 
 
279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  44.05 
 
 
382 aa  209  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  44.05 
 
 
382 aa  209  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  44.05 
 
 
382 aa  209  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  44.05 
 
 
382 aa  209  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  44.05 
 
 
382 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  44.05 
 
 
382 aa  209  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  44.05 
 
 
382 aa  209  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1666  transposase IS3/IS911 family protein  44.05 
 
 
382 aa  209  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  44.05 
 
 
382 aa  209  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>