More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00699 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00699  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06183  integrase  99.55 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06080  hypothetical protein  99.55 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06014  hypothetical protein  99.55 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05621  hypothetical protein  99.1 
 
 		 233 aa  460  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02813  hypothetical protein  99.55 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02886  hypothetical protein  99.55 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06561  integrase  99.1 
 
 		 233 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05658  integrase  99.55 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05750  integrase  99.55 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08185  integrase, catalytic region  99.1 
 
 		 233 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000144763  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02438  hypothetical protein  99.55 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01668  hypothetical protein  99.55 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01946  hypothetical protein  99.55 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01864  hypothetical protein  99.55 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01503  hypothetical protein  99.55 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02412  hypothetical protein  99.55 
 
 		 233 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05650  integrase  99.1 
 
 		 233 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01092  hypothetical protein  99.1 
 
 		 233 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2563  integrase catalytic region  91.44 
 
 		 290 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  hitchhiker  0.0000085301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2575  integrase catalytic region  91.44 
 
 		 290 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02148  hypothetical protein  98.54 
 
 		 217 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05742  hypothetical protein  99.48 
 
 		 208 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08181  transposase  96.61 
 
 		 191 aa  356  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000543405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02327  hypothetical protein  99.38 
 
 		 172 aa  333  9e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1458  transposase  61.68 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  59.72 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0083  integrase catalytic subunit  63.89 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0292  integrase catalytic subunit  63.89 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1325  integrase catalytic subunit  63.89 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00777894  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0977  integrase catalytic subunit  63.89 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.231813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  59.17 
 
 		 293 aa  278  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  58.69 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  58.69 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  58.69 
 
 		 296 aa  272  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0184  Integrase catalytic region  55.61 
 
 		 308 aa  270  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.755567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0135  Integrase catalytic region  55.61 
 
 		 308 aa  270  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1880  Integrase catalytic region  55.61 
 
 		 308 aa  270  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  55.61 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  55.87 
 
 		 325 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4375  integrase catalytic subunit  58.41 
 
 		 276 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  58.96 
 
 		 276 aa  266  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  59.62 
 
 		 245 aa  265  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0048  integrase  56.28 
 
 		 278 aa  261  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1737  putative transposase  53.02 
 
 		 276 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0018  Integrase catalytic region  57.21 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3397  Integrase catalytic region  57.21 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  53.52 
 
 		 307 aa  257  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  53.52 
 
 		 306 aa  256  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  53.52 
 
 		 307 aa  257  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  53.52 
 
 		 307 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  53.52 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  53.05 
 
 		 306 aa  255  3e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  53.05 
 
 		 306 aa  255  3e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2432  Integrase catalytic region  66.11 
 
 		 236 aa  255  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5938  integrase catalytic subunit  53.49 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477937  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2229  integrase catalytic subunit  56.54 
 
 		 290 aa  250  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1540  transposase  64.97 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1305  integrase catalytic subunit  50.68 
 
 		 275 aa  247  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1653  integrase catalytic subunit  50.68 
 
 		 275 aa  247  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1711  integrase catalytic subunit  50.68 
 
 		 275 aa  247  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2285  integrase catalytic subunit  50.68 
 
 		 275 aa  247  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1145  integrase catalytic subunit  53.99 
 
 		 280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.631339  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1304  Integrase catalytic region  54.64 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3076  Integrase catalytic region  53.69 
 
 		 257 aa  232  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000625447 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2623  transposase IS3/IS911 family protein  52.8 
 
 		 369 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.730689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2025  transposase IS3/IS911 family protein  52.8 
 
 		 369 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.40416  normal  0.768967 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0996  integrase, catalytic region  50.93 
 
 		 295 aa  226  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  55.61 
 
 		 305 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0879  Integrase catalytic region  50.74 
 
 		 279 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655608 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0772  Integrase catalytic region  50.74 
 
 		 279 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2413  Integrase catalytic region  50.74 
 
 		 279 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  48.15 
 
 		 278 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  47.69 
 
 		 278 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2322  Integrase catalytic region  51.23 
 
 		 279 aa  211  7.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  43.52 
 
 		 382 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  43.52 
 
 		 382 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  43.52 
 
 		 382 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1666  transposase IS3/IS911 family protein  43.52 
 
 		 382 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  43.52 
 
 		 382 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  43.52 
 
 		 382 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  43.52 
 
 		 382 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  43.52 
 
 		 382 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  43.52 
 
 		 382 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>