More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1540 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1540  transposase  100 
 
 		 239 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  64.32 
 
 		 275 aa  315  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  63.29 
 
 		 296 aa  308  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  63.29 
 
 		 296 aa  308  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4375  integrase catalytic subunit  63.44 
 
 		 276 aa  305  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  62.87 
 
 		 296 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2432  Integrase catalytic region  65 
 
 		 236 aa  301  9e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  62.39 
 
 		 293 aa  298  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2575  integrase catalytic region  58.19 
 
 		 290 aa  294  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2563  integrase catalytic region  58.19 
 
 		 290 aa  294  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  hitchhiker  0.0000085301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0018  Integrase catalytic region  60.62 
 
 		 275 aa  289  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3397  Integrase catalytic region  60.62 
 
 		 275 aa  289  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1458  transposase  60.09 
 
 		 275 aa  289  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  59.64 
 
 		 307 aa  289  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  59.64 
 
 		 307 aa  289  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  59.64 
 
 		 306 aa  288  4e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  59.19 
 
 		 306 aa  288  6e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  59.19 
 
 		 306 aa  288  6e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  58.67 
 
 		 307 aa  288  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1304  Integrase catalytic region  59.64 
 
 		 258 aa  287  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  62.5 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  58.67 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  61.64 
 
 		 325 aa  284  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3076  Integrase catalytic region  60.62 
 
 		 257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000625447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0048  integrase  63.72 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  57.27 
 
 		 308 aa  281  9e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0184  Integrase catalytic region  57.27 
 
 		 308 aa  280  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.755567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0135  Integrase catalytic region  57.27 
 
 		 308 aa  280  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1880  Integrase catalytic region  57.27 
 
 		 308 aa  280  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1305  integrase catalytic subunit  58.15 
 
 		 275 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1653  integrase catalytic subunit  58.15 
 
 		 275 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1711  integrase catalytic subunit  58.15 
 
 		 275 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2285  integrase catalytic subunit  58.15 
 
 		 275 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  68.42 
 
 		 245 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1145  integrase catalytic subunit  55.36 
 
 		 280 aa  270  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.631339  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5938  integrase catalytic subunit  54.82 
 
 		 276 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477937  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0879  Integrase catalytic region  53.91 
 
 		 279 aa  265  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655608 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2413  Integrase catalytic region  53.91 
 
 		 279 aa  265  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01092  hypothetical protein  64.71 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06561  integrase  64.71 
 
 		 233 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0772  Integrase catalytic region  53.48 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05650  integrase  64.71 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01668  hypothetical protein  64.71 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01503  hypothetical protein  64.71 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06183  integrase  64.71 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05750  integrase  64.71 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06014  hypothetical protein  64.71 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06080  hypothetical protein  64.71 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01864  hypothetical protein  64.71 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01946  hypothetical protein  64.71 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02412  hypothetical protein  64.71 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02438  hypothetical protein  64.71 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02886  hypothetical protein  64.71 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02813  hypothetical protein  64.71 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05658  integrase  64.71 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1325  integrase catalytic subunit  64.4 
 
 		 262 aa  262  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00777894  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0977  integrase catalytic subunit  64.4 
 
 		 262 aa  262  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.231813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0083  integrase catalytic subunit  64.4 
 
 		 262 aa  262  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0292  integrase catalytic subunit  64.4 
 
 		 262 aa  262  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05742  hypothetical protein  64.71 
 
 		 208 aa  262  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08185  integrase, catalytic region  64.17 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000144763  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05621  hypothetical protein  64.17 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2229  integrase catalytic subunit  52.36 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141221 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1737  putative transposase  51.75 
 
 		 276 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  52.74 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2322  Integrase catalytic region  53.48 
 
 		 279 aa  253  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08181  transposase  64.09 
 
 		 191 aa  251  7e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000543405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00699  hypothetical protein  64.97 
 
 		 222 aa  250  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  49.78 
 
 		 278 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  49.34 
 
 		 278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0996  integrase, catalytic region  51.13 
 
 		 295 aa  243  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02148  hypothetical protein  65.12 
 
 		 217 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2623  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 		 369 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.730689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2025  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 		 369 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.40416  normal  0.768967 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02327  hypothetical protein  62.35 
 
 		 172 aa  230  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3028  integrase catalytic subunit  56.22 
 
 		 245 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  45.73 
 
 		 382 aa  228  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  45.73 
 
 		 382 aa  228  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  45.73 
 
 		 382 aa  228  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  45.73 
 
 		 382 aa  228  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  45.73 
 
 		 382 aa  228  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  45.73 
 
 		 382 aa  228  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  45.73 
 
 		 382 aa  228  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  45.73 
 
 		 382 aa  228  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>