More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0539 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  100 
 
 		 293 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  66.1 
 
 		 296 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  66.1 
 
 		 296 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  65.75 
 
 		 296 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  67.04 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  60.42 
 
 		 275 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2432  Integrase catalytic region  70.09 
 
 		 236 aa  348  4e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  69.43 
 
 		 245 aa  343  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4375  integrase catalytic subunit  58.09 
 
 		 276 aa  330  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2575  integrase catalytic region  56.79 
 
 		 290 aa  325  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2563  integrase catalytic region  56.79 
 
 		 290 aa  325  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  hitchhiker  0.0000085301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3397  Integrase catalytic region  57.04 
 
 		 275 aa  324  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0018  Integrase catalytic region  57.04 
 
 		 275 aa  324  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1305  integrase catalytic subunit  56.49 
 
 		 275 aa  322  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1653  integrase catalytic subunit  56.49 
 
 		 275 aa  322  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1711  integrase catalytic subunit  56.49 
 
 		 275 aa  322  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2285  integrase catalytic subunit  56.49 
 
 		 275 aa  322  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1145  integrase catalytic subunit  56.88 
 
 		 280 aa  320  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.631339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1458  transposase  55.93 
 
 		 275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0048  integrase  58.58 
 
 		 278 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  55.68 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  55.68 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  55.68 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  55.68 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  55.68 
 
 		 288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  55.3 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  55.3 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1737  putative transposase  56.39 
 
 		 276 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5938  integrase catalytic subunit  54.68 
 
 		 276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477937  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0292  integrase catalytic subunit  63.6 
 
 		 262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1325  integrase catalytic subunit  63.6 
 
 		 262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00777894  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0977  integrase catalytic subunit  63.6 
 
 		 262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.231813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0083  integrase catalytic subunit  63.6 
 
 		 262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1540  transposase  62.39 
 
 		 239 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0135  Integrase catalytic region  52.08 
 
 		 308 aa  296  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0184  Integrase catalytic region  52.08 
 
 		 308 aa  296  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.755567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1880  Integrase catalytic region  52.08 
 
 		 308 aa  296  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  52.08 
 
 		 308 aa  296  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  52.33 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3076  Integrase catalytic region  55.64 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000625447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05621  hypothetical protein  58.7 
 
 		 233 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  53.18 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01503  hypothetical protein  58.7 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02886  hypothetical protein  58.7 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06014  hypothetical protein  58.7 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02438  hypothetical protein  58.7 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06183  integrase  58.7 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01668  hypothetical protein  58.7 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01946  hypothetical protein  58.7 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02813  hypothetical protein  58.7 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02412  hypothetical protein  58.7 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01864  hypothetical protein  58.7 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05658  integrase  58.7 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06080  hypothetical protein  58.7 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05750  integrase  58.7 
 
 		 233 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05650  integrase  58.7 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06561  integrase  58.7 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01092  hypothetical protein  58.7 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0879  Integrase catalytic region  52.61 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655608 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2413  Integrase catalytic region  52.61 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08185  integrase, catalytic region  58.26 
 
 		 233 aa  287  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000144763  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0772  Integrase catalytic region  52.24 
 
 		 279 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2322  Integrase catalytic region  52.33 
 
 		 279 aa  286  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1304  Integrase catalytic region  56.6 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2229  integrase catalytic subunit  51.48 
 
 		 290 aa  279  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141221 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00699  hypothetical protein  59.17 
 
 		 222 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2025  transposase IS3/IS911 family protein  46.57 
 
 		 369 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.40416  normal  0.768967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2623  transposase IS3/IS911 family protein  46.57 
 
 		 369 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.730689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05742  hypothetical protein  62.56 
 
 		 208 aa  264  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02148  hypothetical protein  60.59 
 
 		 217 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  47.39 
 
 		 278 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0996  integrase, catalytic region  47.39 
 
 		 295 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08181  transposase  63.74 
 
 		 191 aa  253  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000543405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02327  hypothetical protein  61.99 
 
 		 172 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  41.58 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  41.58 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  41.58 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 382 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 382 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 382 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 382 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 382 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  41.22 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>