More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1304 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1304  Integrase catalytic region  100 
 
 		 258 aa  542  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  99.59 
 
 		 307 aa  517  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  99.59 
 
 		 307 aa  517  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  100 
 
 		 306 aa  518  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  99.19 
 
 		 306 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  99.19 
 
 		 306 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  94.72 
 
 		 307 aa  494  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  94.72 
 
 		 288 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1880  Integrase catalytic region  69.8 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0184  Integrase catalytic region  69.8 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.755567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0135  Integrase catalytic region  69.8 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  69.39 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0429  integrase catalytic subunit  66.96 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3028  integrase catalytic subunit  70.94 
 
 		 245 aa  291  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  60.35 
 
 		 275 aa  288  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1540  transposase  59.64 
 
 		 239 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  56.6 
 
 		 293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0018  Integrase catalytic region  55.74 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3397  Integrase catalytic region  55.74 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0048  integrase  61.95 
 
 		 278 aa  275  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  55.6 
 
 		 296 aa  274  8e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  55.6 
 
 		 296 aa  274  8e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  55.6 
 
 		 296 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2575  integrase catalytic region  51.25 
 
 		 290 aa  271  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2563  integrase catalytic region  51.25 
 
 		 290 aa  271  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0034021  hitchhiker  0.0000085301 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1145  integrase catalytic subunit  52.32 
 
 		 280 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.631339  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3076  Integrase catalytic region  54.04 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000625447 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2432  Integrase catalytic region  51.5 
 
 		 236 aa  255  6e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.672579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  51.5 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0996  integrase, catalytic region  49.79 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02412  hypothetical protein  54.87 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02886  hypothetical protein  54.87 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02813  hypothetical protein  54.87 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06183  integrase  54.87 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05658  integrase  54.87 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02438  hypothetical protein  54.87 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01668  hypothetical protein  54.87 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01946  hypothetical protein  54.87 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01864  hypothetical protein  54.87 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01503  hypothetical protein  54.87 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06014  hypothetical protein  54.87 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06080  hypothetical protein  54.87 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05750  integrase  54.87 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05742  hypothetical protein  54.87 
 
 		 208 aa  248  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05650  integrase  54.87 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01092  hypothetical protein  54.87 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06561  integrase  54.87 
 
 		 233 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4375  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 276 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1325  integrase catalytic subunit  57.07 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00777894  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0083  integrase catalytic subunit  57.07 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0292  integrase catalytic subunit  57.07 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0977  integrase catalytic subunit  57.07 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.231813  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  56 
 
 		 245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05621  hypothetical protein  54.36 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08185  integrase, catalytic region  54.36 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000144763  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2413  Integrase catalytic region  51.09 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0879  Integrase catalytic region  51.09 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1458  transposase  47.88 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0772  Integrase catalytic region  50.66 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.422542 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2322  Integrase catalytic region  53.54 
 
 		 279 aa  242  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1305  integrase catalytic subunit  50.21 
 
 		 275 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1653  integrase catalytic subunit  50.21 
 
 		 275 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1711  integrase catalytic subunit  50.21 
 
 		 275 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2285  integrase catalytic subunit  50.21 
 
 		 275 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2229  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 290 aa  238  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141221 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3665  Integrase catalytic region  50.82 
 
 		 305 aa  236  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2623  transposase IS3/IS911 family protein  45.57 
 
 		 369 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.730689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2025  transposase IS3/IS911 family protein  45.57 
 
 		 369 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.40416  normal  0.768967 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08181  transposase  55.25 
 
 		 191 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000543405  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00699  hypothetical protein  54.64 
 
 		 222 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  46.61 
 
 		 278 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5938  integrase catalytic subunit  48.36 
 
 		 276 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  46.19 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  43.5 
 
 		 382 aa  224  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  43.5 
 
 		 382 aa  224  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  43.5 
 
 		 382 aa  224  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  43.5 
 
 		 382 aa  224  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  43.5 
 
 		 382 aa  224  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  43.5 
 
 		 382 aa  224  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  43.5 
 
 		 382 aa  224  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  43.5 
 
 		 382 aa  224  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1666  transposase IS3/IS911 family protein  45.06 
 
 		 382 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  43.09 
 
 		 382 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02148  hypothetical protein  55.95 
 
 		 217 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>