14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3237 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3237  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  244  4e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  99.16 
 
 
459 aa  242  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  99.16 
 
 
459 aa  242  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  98.32 
 
 
459 aa  239  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  98.32 
 
 
459 aa  239  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  49.12 
 
 
341 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  49.07 
 
 
441 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  49.07 
 
 
441 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  49.07 
 
 
441 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  49.07 
 
 
441 aa  91.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  36.62 
 
 
417 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  36.62 
 
 
417 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  36.62 
 
 
417 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  32.53 
 
 
416 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>