77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1495 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5778  integrase catalytic region  61.97 
 
 		 662 aa  802    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1495  integrase catalytic region  100 
 
 		 657 aa  1347    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170756 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0151  hypothetical protein  65.42 
 
 		 456 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6244  hypothetical protein  39.88 
 
 		 650 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0178  hypothetical protein  34.85 
 
 		 659 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00166978  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0284  hypothetical protein  34.85 
 
 		 659 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1315  hypothetical protein  30.68 
 
 		 659 aa  264  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0292407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2056  hypothetical protein  29.03 
 
 		 675 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12326  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4630  hypothetical protein  30.53 
 
 		 678 aa  193  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169623 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6589  hypothetical protein  34.46 
 
 		 444 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2253  hypothetical protein  26.61 
 
 		 635 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000796594  normal  0.115839 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5261  hypothetical protein  28.6 
 
 		 675 aa  173  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.897267  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5598  hypothetical protein  28.6 
 
 		 675 aa  173  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00554  hypothetical protein  27.7 
 
 		 630 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0150  hypothetical protein  45.19 
 
 		 135 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.865216  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  28.77 
 
 		 721 aa  88.6  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1647  transposase  24.75 
 
 		 616 aa  71.6  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1364  integrase catalytic subunit  26.59 
 
 		 782 aa  63.9  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565486  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0729  transposase, putative  28.93 
 
 		 704 aa  62  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648986  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1249  hypothetical protein  25.65 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1859  integrase catalytic subunit  27.01 
 
 		 791 aa  60.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0041  TniAdelta1  27.83 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.208656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0458  integrase catalytic subunit  27.04 
 
 		 710 aa  57.4  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.540763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4972  transposase  27.42 
 
 		 562 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0764461  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1173  integrase TniA  27.67 
 
 		 560 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3010  integrase catalytic subunit  27.42 
 
 		 509 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00333302 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  29.08 
 
 		 649 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4045  transposase  27.42 
 
 		 572 aa  56.6  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370062  normal  0.501685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0025  integrase catalytic subunit  27.71 
 
 		 810 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  25.75 
 
 		 677 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2082  Transposase-like Mu  23.73 
 
 		 555 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000413728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  25.75 
 
 		 652 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  25.75 
 
 		 652 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  25.75 
 
 		 652 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4752  integrase catalytic region  25 
 
 		 754 aa  54.3  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4720  Integrase catalytic region  26.83 
 
 		 670 aa  53.9  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.086869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1519  Integrase catalytic region  26.89 
 
 		 774 aa  53.9  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2171  integrase catalytic subunit  27.34 
 
 		 556 aa  52.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  25.4 
 
 		 547 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3222  integrase catalytic subunit  30.2 
 
 		 539 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196436  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2648  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 		 556 aa  53.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.363679  normal  0.0869541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1346  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 		 556 aa  53.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1222  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 		 556 aa  53.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3542  hypothetical protein  23.56 
 
 		 689 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1342  integrase catalytic subunit  26.07 
 
 		 663 aa  51.6  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139428 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  23.73 
 
 		 480 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  23.73 
 
 		 480 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  22.18 
 
 		 653 aa  51.2  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1241  hypothetical protein  43.24 
 
 		 115 aa  50.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.923089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2955  prophage MuMc02, transposase protein A, putative  28.46 
 
 		 709 aa  50.4  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.456308  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1192  integrase, catalytic region  25.23 
 
 		 740 aa  50.8  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155684  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2186  integrase catalytic subunit  23.4 
 
 		 581 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.347784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4200  Integrase catalytic region  22.97 
 
 		 617 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6595  transposase  26.24 
 
 		 542 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3862  integrase catalytic subunit  22.3 
 
 		 617 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015096 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4579  integrase catalytic subunit  25.44 
 
 		 551 aa  47.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2981  Transposase-like Mu  22.12 
 
 		 567 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6241  integrase catalytic subunit  27.85 
 
 		 536 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  25.67 
 
 		 738 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  25.67 
 
 		 738 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3183  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 		 634 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0522653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0613  integrase catalytic subunit  27.24 
 
 		 634 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.514295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  26.41 
 
 		 558 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  24.87 
 
 		 497 aa  45.8  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  24.87 
 
 		 497 aa  45.8  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  24.87 
 
 		 497 aa  45.8  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  26.41 
 
 		 558 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2538  hypothetical protein  26.81 
 
 		 762 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  23.26 
 
 		 481 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0496  integrase  29.06 
 
 		 523 aa  44.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.772953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06969  hypothetical protein  25.4 
 
 		 487 aa  44.3  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3659  integrase catalytic subunit  26.7 
 
 		 785 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4717  Integrase catalytic region  24.73 
 
 		 749 aa  43.9  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4222  integrase catalytic subunit  25.4 
 
 		 541 aa  43.9  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4306  integrase catalytic subunit  25.4 
 
 		 541 aa  43.9  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4384  integrase catalytic subunit  25.4 
 
 		 541 aa  43.9  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4604  integrase catalytic subunit  25.4 
 
 		 541 aa  43.9  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>