22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2056 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2056  hypothetical protein  100 
 
 
675 aa  1390    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12326  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4630  hypothetical protein  50.24 
 
 
678 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169623 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5598  hypothetical protein  52.25 
 
 
675 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5261  hypothetical protein  52.25 
 
 
675 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.897267  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6589  hypothetical protein  46.63 
 
 
444 aa  365  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0178  hypothetical protein  33.33 
 
 
659 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00166978  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0284  hypothetical protein  33.33 
 
 
659 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1315  hypothetical protein  31.2 
 
 
659 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0292407  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5778  integrase catalytic region  28.45 
 
 
662 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13282  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1495  integrase catalytic region  29.03 
 
 
657 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170756 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6244  hypothetical protein  28.57 
 
 
650 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0151  hypothetical protein  29.85 
 
 
456 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2253  hypothetical protein  25.2 
 
 
635 aa  156  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000796594  normal  0.115839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00554  hypothetical protein  32.75 
 
 
630 aa  140  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1249  hypothetical protein  26.58 
 
 
313 aa  66.6  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0014  transposase, putative  24.29 
 
 
677 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285018  unclonable  0.000000281565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0006  integrase catalytic subunit  24.29 
 
 
652 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0485417  normal  0.154735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0008  integrase catalytic region  24.29 
 
 
652 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171023  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0006  integrase catalytic region  24.29 
 
 
652 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  24.23 
 
 
721 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  23.79 
 
 
649 aa  50.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  23.62 
 
 
653 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>