15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2253 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2253  hypothetical protein  100 
 
 		 635 aa  1313    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000796594  normal  0.115839 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 659 aa  313  9e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0292407  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0178  hypothetical protein  28.87 
 
 		 659 aa  225  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00166978  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0284  hypothetical protein  28.87 
 
 		 659 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5778  integrase catalytic region  26.52 
 
 		 662 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6244  hypothetical protein  25.08 
 
 		 650 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1495  integrase catalytic region  26.61 
 
 		 657 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2056  hypothetical protein  25.2 
 
 		 675 aa  156  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12326  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0151  hypothetical protein  25.84 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4630  hypothetical protein  23.43 
 
 		 678 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169623 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6589  hypothetical protein  26.14 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5261  hypothetical protein  23.25 
 
 		 675 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.897267  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5598  hypothetical protein  23.25 
 
 		 675 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00554  hypothetical protein  25.11 
 
 		 630 aa  106  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1249  hypothetical protein  26.19 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>