17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1315 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1315  hypothetical protein  100 
 
 		 659 aa  1345    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0292407  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0178  hypothetical protein  32.5 
 
 		 659 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00166978  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0284  hypothetical protein  32.5 
 
 		 659 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2253  hypothetical protein  33.33 
 
 		 635 aa  313  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000796594  normal  0.115839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2056  hypothetical protein  31.2 
 
 		 675 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12326  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1495  integrase catalytic region  30.68 
 
 		 657 aa  265  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170756 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5778  integrase catalytic region  30.8 
 
 		 662 aa  248  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6244  hypothetical protein  29.93 
 
 		 650 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4630  hypothetical protein  31.55 
 
 		 678 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169623 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5598  hypothetical protein  30.12 
 
 		 675 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5261  hypothetical protein  30.12 
 
 		 675 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.897267  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0151  hypothetical protein  31.11 
 
 		 456 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6589  hypothetical protein  30.31 
 
 		 444 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00554  hypothetical protein  26.53 
 
 		 630 aa  143  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1249  hypothetical protein  29.36 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2352  integrase catalytic region  26.48 
 
 		 721 aa  52.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109072 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0015  integrase catalytic region  24.5 
 
 		 653 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>